91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0084 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  100 
 
 
461 aa  944    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  57.68 
 
 
471 aa  553  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  53.45 
 
 
453 aa  512  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  50.88 
 
 
457 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  52.48 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  46.7 
 
 
453 aa  432  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  48.17 
 
 
454 aa  428  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  46.49 
 
 
448 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  47.13 
 
 
450 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  47.82 
 
 
450 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  33.33 
 
 
493 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  33.87 
 
 
498 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
457 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
495 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  27.6 
 
 
448 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
509 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  30.07 
 
 
441 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  27.47 
 
 
458 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  37.77 
 
 
502 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  35.71 
 
 
507 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  38.96 
 
 
501 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  35.48 
 
 
551 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  36.75 
 
 
502 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  35.53 
 
 
505 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  36.14 
 
 
524 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  36.32 
 
 
519 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  34.54 
 
 
551 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
551 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  34.54 
 
 
551 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  36.91 
 
 
501 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  35.69 
 
 
531 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  35.69 
 
 
531 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  37.13 
 
 
530 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  34.27 
 
 
551 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  34.92 
 
 
518 aa  153  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  34.65 
 
 
531 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  25.12 
 
 
443 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  34.65 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  27.38 
 
 
428 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  36.12 
 
 
500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  34.3 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  33.33 
 
 
514 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
443 aa  63.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  21.74 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.95 
 
 
527 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  20.38 
 
 
432 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  23.29 
 
 
635 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
415 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.42 
 
 
421 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  24.44 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  18.71 
 
 
426 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  20.51 
 
 
674 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  24.37 
 
 
524 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  37.93 
 
 
467 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.13 
 
 
472 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.29 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  28.49 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.35 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  27.64 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.03 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.63 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.56 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  27.64 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.32 
 
 
481 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  27.64 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  27.64 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  36.21 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.32 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.32 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  28.46 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  21.7 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  28.46 
 
 
464 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  20.62 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.64 
 
 
460 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  27.64 
 
 
479 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  27.64 
 
 
479 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  27.64 
 
 
479 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.93 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  27.64 
 
 
460 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.03 
 
 
460 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.11 
 
 
471 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
423 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  42.11 
 
 
505 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  27.64 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  27.64 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>