More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0080 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1061    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  34.33 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  31.47 
 
 
541 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  30.04 
 
 
500 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  29.51 
 
 
506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.71 
 
 
500 aa  194  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0011  glycosyltransferase  25.44 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.27 
 
 
490 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.27 
 
 
490 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  27.53 
 
 
500 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.24 
 
 
496 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.24 
 
 
496 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2591  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
478 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.97646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.31 
 
 
502 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.87 
 
 
440 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  27.84 
 
 
743 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
394 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  30.42 
 
 
419 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
808 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  31.17 
 
 
378 aa  103  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
388 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
443 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  28.09 
 
 
416 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
383 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
365 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  30.68 
 
 
385 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
396 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
660 aa  96.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
390 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  23.8 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  23.8 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.12 
 
 
502 aa  95.5  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.71 
 
 
501 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
415 aa  94  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
364 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
419 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  23.21 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.07 
 
 
496 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  29.61 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
388 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
386 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
355 aa  90.1  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
392 aa  90.1  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
392 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
420 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
420 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
361 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
420 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
420 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.68 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
669 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  22.01 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
890 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
387 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
1264 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
353 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.73 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
401 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  30.88 
 
 
350 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
436 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  28.04 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  26.52 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>