More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0076 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 464 aa  924    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  61.05 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  38.73 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  33.49 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  32.54 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 451 aa  136  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  28.3 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.77 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.77 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.77 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.28 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.28 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 491 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  25.21 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.28 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  25.21 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.92 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0060  amino acid transporter  29.07 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.490002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.71 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  24.84 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.06 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.64 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.36 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.36 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.29 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.88 
 
 		 466 aa  90.5  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.29 
 
 		 438 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 429 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.21 
 
 		 471 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 485 aa  90.1  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.43 
 
 		 467 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  26.15 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  23.48 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  23.7 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.65 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  25.87 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.3 
 
 		 520 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  26.87 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.59 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  23.41 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  25.74 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.59 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  24.28 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  24.64 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  22.44 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.69 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  26.57 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  24.11 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  24.32 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.06 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  26.27 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  25.07 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  26.27 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  26.27 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>