More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0063 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  44.17 
 
 
245 aa  209  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  40.35 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.09 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.36 
 
 
250 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  40 
 
 
237 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.86 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  34.57 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  41.38 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  37.82 
 
 
241 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  40.1 
 
 
238 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  38.57 
 
 
231 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  42.79 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  38.25 
 
 
241 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  39.9 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  42.65 
 
 
238 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  38.68 
 
 
227 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  36.7 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  37.5 
 
 
253 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  36.32 
 
 
237 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  38.99 
 
 
230 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.82 
 
 
238 aa  141  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  34.62 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  41.5 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  36.7 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  37.91 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  39.29 
 
 
241 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  38.01 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  37.16 
 
 
602 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  38 
 
 
252 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  40.76 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  39.49 
 
 
250 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  37.82 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  37.92 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  37.91 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  38.79 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  35 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  36.16 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  38.79 
 
 
236 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  37.83 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  38.79 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  35.04 
 
 
240 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  35.04 
 
 
251 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  35.04 
 
 
240 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  38.1 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  37.91 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  37.88 
 
 
255 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  37.09 
 
 
260 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  35.44 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  38.89 
 
 
259 aa  129  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.68 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.69 
 
 
242 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  35.5 
 
 
312 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  37.74 
 
 
251 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  35.29 
 
 
280 aa  124  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.19 
 
 
279 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  35.71 
 
 
250 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  35.71 
 
 
250 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  33.79 
 
 
252 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  37.69 
 
 
237 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  29.09 
 
 
240 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  36.41 
 
 
264 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.65 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  35.21 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  35.35 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  38.46 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  34.5 
 
 
267 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  31.69 
 
 
293 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  35.89 
 
 
237 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  34.08 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  31.71 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  32.55 
 
 
305 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  32.55 
 
 
305 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.26 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  35.51 
 
 
238 aa  112  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  32.02 
 
 
285 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  33.8 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  36.54 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  31.96 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  35.78 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  37.95 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  30.73 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  33.16 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  34.91 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  31.13 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  37.2 
 
 
239 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  37.06 
 
 
259 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  35.91 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  31.34 
 
 
258 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  35.91 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
250 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  35.89 
 
 
274 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  34.92 
 
 
267 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  34.22 
 
 
275 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  35.91 
 
 
254 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  35.35 
 
 
254 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  32.64 
 
 
277 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>