20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0060 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  777    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  26.32 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  26.3 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  26.89 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  26.18 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  26.18 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  26.63 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  26.37 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.19 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  31.93 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  25.41 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25.18 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  24.58 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  24.58 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  24.58 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  24.58 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  24.58 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0764  chloride channel  22.75 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0676737 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1602  chloride channel  22.55 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.6 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>