More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0059 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 415 aa  854    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000404489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0711  Signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.890851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1327  sensor histidine kinase  38.78 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0088456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23920  histidine kinase  32.61 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000513114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  31.81 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  33.57 
 
 		 430 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  26.83 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  26.73 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  32.73 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  26.44 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  26.54 
 
 		 432 aa  125  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  33.62 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  27.83 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  31.12 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  31.58 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  23.92 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  24.52 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0984  sensor histidine kinase CiaH  32.26 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.805926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 458 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  31.05 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1791  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  27.42 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1844  Signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.63 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  28.77 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 475 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  27.95 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.8 
 
 		 486 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 350 aa  96.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.34 
 
 		 481 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 524 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 529 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 582 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0037  histidine kinase  25.4 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 581 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 591 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 608 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  31.17 
 
 		 584 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  24.35 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  29.1 
 
 		 527 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.44 
 
 		 467 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  27.27 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.44 
 
 		 467 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  23.48 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 608 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 604 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.37 
 
 		 467 aa  90.5  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 474 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 601 aa  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  29.36 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  26.55 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.94 
 
 		 467 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 701 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.7 
 
 		 477 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  26.55 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 551 aa  88.2  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  27.31 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  30.6 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.98 
 
 		 467 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 621 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>