More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0055 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  61.36 
 
 
223 aa  268  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  57.92 
 
 
228 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  58.64 
 
 
223 aa  259  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  50.23 
 
 
220 aa  204  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  44.67 
 
 
215 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  48.68 
 
 
219 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  43.2 
 
 
585 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  43.98 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  40.09 
 
 
219 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  40.57 
 
 
219 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  40.09 
 
 
219 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  40.09 
 
 
219 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  41.04 
 
 
219 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  40.09 
 
 
219 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  39.62 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  39.62 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  45.97 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  44.21 
 
 
221 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  38.89 
 
 
219 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  42.21 
 
 
216 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  38.79 
 
 
214 aa  154  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  39.53 
 
 
216 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  41.24 
 
 
219 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  36.7 
 
 
218 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  40.39 
 
 
219 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  41.98 
 
 
986 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  37.82 
 
 
209 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  38.86 
 
 
227 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  39.34 
 
 
230 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  38.5 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  38.54 
 
 
207 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  37.5 
 
 
215 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  37.99 
 
 
208 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  37.31 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  36.51 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  37.37 
 
 
978 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  37.24 
 
 
221 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  34.2 
 
 
965 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.81 
 
 
246 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.09 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.63 
 
 
233 aa  89  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  27.14 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.9 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.69 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.9 
 
 
456 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.13 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.05 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.29 
 
 
525 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.05 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.35 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.82 
 
 
456 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.44 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  26.63 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.63 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  28.49 
 
 
188 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.55 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.8 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.1 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.35 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.06 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.65 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.19 
 
 
1053 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
202 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.29 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.44 
 
 
1314 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.25 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.73 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  26.98 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.02 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.77 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.42 
 
 
1051 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.77 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.42 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  26.37 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  26.37 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  26.37 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.74 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.1 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  25.35 
 
 
396 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.05 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.42 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.17 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.36 
 
 
1125 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.09 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>