63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0053 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  79.82 
 
 
457 aa  737    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  100 
 
 
449 aa  904    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  72.04 
 
 
453 aa  669    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  65.56 
 
 
450 aa  590  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  64.65 
 
 
450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  55.73 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  55.03 
 
 
448 aa  504  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  56.06 
 
 
453 aa  486  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  52.12 
 
 
454 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  52.48 
 
 
461 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  39.02 
 
 
498 aa  309  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  38.88 
 
 
493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
457 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
509 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  33.11 
 
 
441 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  31.89 
 
 
531 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  31.69 
 
 
531 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  31.88 
 
 
448 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  30.14 
 
 
502 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  42.5 
 
 
507 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  39.48 
 
 
505 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  40.09 
 
 
501 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  40.33 
 
 
530 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  27.99 
 
 
443 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  39.67 
 
 
529 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  38.49 
 
 
502 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  42.6 
 
 
501 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  41.3 
 
 
524 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  40.25 
 
 
551 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  40.52 
 
 
519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  40.25 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  40.25 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  40.95 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  43.69 
 
 
500 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  41.13 
 
 
551 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  44 
 
 
514 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  27.9 
 
 
458 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  40.34 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  35.11 
 
 
518 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
495 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  28.15 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
457 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
459 aa  66.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  24.29 
 
 
524 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  24.88 
 
 
424 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.06 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  21.19 
 
 
523 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  23.76 
 
 
519 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.57 
 
 
527 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  23.4 
 
 
519 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  24.85 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  33.04 
 
 
405 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.06 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.27 
 
 
432 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
405 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  30.08 
 
 
508 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  30.08 
 
 
508 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  30.08 
 
 
508 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>