More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0045 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  52.13 
 
 		 734 aa  647    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1303  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  70.5 
 
 		 702 aa  1029    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0310613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2624  ATPase  62.09 
 
 		 701 aa  885    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0045  ATPase  100 
 
 		 745 aa  1508    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0572  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  70.24 
 
 		 720 aa  1014    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.544147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0150  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  70.45 
 
 		 716 aa  998    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2571  ATPase  62.09 
 
 		 701 aa  885    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1578  ATP-dependent proteinase ATP-binding subunit  74.93 
 
 		 699 aa  1060    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.62 
 
 		 684 aa  630  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  51.33 
 
 		 726 aa  625  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.8 
 
 		 748 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  52.46 
 
 		 722 aa  618  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  47.52 
 
 		 725 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  47.7 
 
 		 814 aa  601  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  49.45 
 
 		 753 aa  596  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  50.4 
 
 		 712 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  49.38 
 
 		 752 aa  597  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  47.18 
 
 		 811 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  47.67 
 
 		 818 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  48.93 
 
 		 840 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  47.67 
 
 		 818 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  49.35 
 
 		 812 aa  589  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1809  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.17 
 
 		 705 aa  590  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000172721  hitchhiker  0.000000000383819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  47.68 
 
 		 812 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  46.89 
 
 		 812 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  46.57 
 
 		 810 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  45.66 
 
 		 818 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  47.63 
 
 		 819 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  46.99 
 
 		 810 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  47.63 
 
 		 841 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  47.91 
 
 		 837 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  46.63 
 
 		 846 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  48.54 
 
 		 816 aa  582  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.08 
 
 		 862 aa  581  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  46.82 
 
 		 846 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.98 
 
 		 817 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  48.44 
 
 		 789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  48.5 
 
 		 791 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  45.86 
 
 		 829 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  47.63 
 
 		 869 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  46.77 
 
 		 847 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  46.9 
 
 		 823 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  45.8 
 
 		 841 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.59 
 
 		 834 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  45.51 
 
 		 848 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  46.51 
 
 		 830 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  46.94 
 
 		 848 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  46.13 
 
 		 826 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  46.99 
 
 		 803 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  45.81 
 
 		 812 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  46.41 
 
 		 810 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  45.97 
 
 		 824 aa  568  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  47.87 
 
 		 791 aa  571  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  47.02 
 
 		 830 aa  571  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  46.74 
 
 		 830 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  45.83 
 
 		 815 aa  571  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.77 
 
 		 828 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  45.03 
 
 		 839 aa  571  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.22 
 
 		 851 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  46.99 
 
 		 835 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.55 
 
 		 854 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  44.54 
 
 		 842 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  45.78 
 
 		 824 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  44.71 
 
 		 855 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  46.05 
 
 		 811 aa  565  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  45.3 
 
 		 852 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  47.57 
 
 		 824 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  48.35 
 
 		 886 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  47.75 
 
 		 826 aa  568  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  45.41 
 
 		 868 aa  568  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  46.64 
 
 		 847 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  45.05 
 
 		 842 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  45.45 
 
 		 825 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  45.01 
 
 		 837 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  44.64 
 
 		 824 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.37 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.37 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  46.37 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  46.37 
 
 		 811 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  44.81 
 
 		 830 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.43 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  45.17 
 
 		 830 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  46.23 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.37 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  44 
 
 		 842 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  45.9 
 
 		 848 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  45.8 
 
 		 894 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  44.23 
 
 		 829 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  46.25 
 
 		 812 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  46.02 
 
 		 824 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.22 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.37 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  44.56 
 
 		 843 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.37 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  45.35 
 
 		 847 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  45.11 
 
 		 841 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  45.64 
 
 		 812 aa  560  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  45.81 
 
 		 781 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  44.69 
 
 		 846 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  47.72 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>