More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0019 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.93 
 
 
236 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.32 
 
 
237 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  75.43 
 
 
235 aa  361  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  72.65 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  73.08 
 
 
235 aa  359  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  72.65 
 
 
235 aa  358  5e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  73.8 
 
 
235 aa  356  2e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  72.22 
 
 
235 aa  355  4e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  69.66 
 
 
235 aa  345  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  66.95 
 
 
233 aa  340  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  67.97 
 
 
233 aa  339  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  67.97 
 
 
233 aa  339  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  69.53 
 
 
236 aa  335  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  69.4 
 
 
233 aa  331  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  66.38 
 
 
237 aa  322  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.14 
 
 
230 aa  289  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.39 
 
 
230 aa  285  6e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  59.83 
 
 
232 aa  282  3e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.01 
 
 
230 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 
234 aa  265  3e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  57.2 
 
 
234 aa  262  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  57.2 
 
 
234 aa  262  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 
229 aa  261  5e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  55.98 
 
 
236 aa  255  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.24 
 
 
235 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.08 
 
 
234 aa  254  1e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 
238 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.52217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  53.78 
 
 
239 aa  245  5e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  53.78 
 
 
239 aa  245  5e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 
239 aa  244  1e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  53.62 
 
 
239 aa  244  1e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  53.62 
 
 
239 aa  243  2e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  53.62 
 
 
239 aa  243  2e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  53.62 
 
 
239 aa  243  2e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  53.62 
 
 
239 aa  243  2e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  53.62 
 
 
239 aa  243  2e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  53.62 
 
 
239 aa  243  2e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  52.44 
 
 
226 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  53.3 
 
 
239 aa  235  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  51.95 
 
 
229 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 
232 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
239 aa  233  2e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.94698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
239 aa  231  8e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.20928e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 
229 aa  231  8e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  50 
 
 
228 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 
233 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 
235 aa  228  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 
236 aa  228  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.4965e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
226 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
228 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
231 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  50.89 
 
 
230 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 
226 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  50.86 
 
 
230 aa  224  9e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 
227 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 
237 aa  224  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
225 aa  223  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.23011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  46.52 
 
 
234 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  48.66 
 
 
229 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 
229 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 
231 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  49.56 
 
 
228 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
229 aa  221  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.77 
 
 
226 aa  221  8e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
228 aa  221  1e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 
226 aa  220  1e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
228 aa  221  1e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
228 aa  221  1e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  47.35 
 
 
227 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
228 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 
232 aa  219  4e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 
232 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 
232 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 
232 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 
232 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
228 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  50 
 
 
238 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 
227 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.51147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 
234 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
226 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.66 
 
 
229 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 
227 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
226 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
228 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  50 
 
 
226 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 
226 aa  216  3e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.76926e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
232 aa  216  3e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
232 aa  216  3e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 
238 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  52.59 
 
 
231 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>