More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0012 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  100 
 
 		 463 aa  947    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  59.96 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  57.4 
 
 		 453 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  61.37 
 
 		 455 aa  528  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  58.71 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  57.17 
 
 		 451 aa  518  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  56.26 
 
 		 449 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  56.14 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  57.59 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  57.81 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  53.36 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  53.16 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  53.04 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  53.04 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  49.66 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.44 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  48.55 
 
 		 448 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.19 
 
 		 456 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  50.34 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1965  primary replicative DNA helicase  46.22 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.07 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  45.33 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  45.97 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  46.22 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  46 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.96 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  45.3 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  47.11 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.74 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  43.72 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.88 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  59.33 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.97 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  44.79 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 462 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  41.91 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.36 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  43.23 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  44.74 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  42 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  43.26 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  43.01 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  43.26 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  43.33 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  42.04 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  41.96 
 
 		 462 aa  382  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  40.97 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  43.17 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.14 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  46.36 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  41.91 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  44.81 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  43.71 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  42.61 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  44.15 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  43.01 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  43.01 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  40.98 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  43.04 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  44.07 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  41.01 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  44.49 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  41.74 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  41.74 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  41.07 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  43.58 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  41.61 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  41.29 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.11 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>