More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0011 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  61.22 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  61.07 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  57.33 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  52.35 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  56.38 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 148 aa  146  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  54 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2140  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  51.7 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.9 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  40.41 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.06 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 148 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  36.99 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  40.65 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.57 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.41 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 178 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  37.58 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  36.42 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.26 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>