More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0005 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  65.94 
 
 		 640 aa  826    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.13 
 
 		 651 aa  658    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  57.97 
 
 		 635 aa  713    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.95 
 
 		 642 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  52.9 
 
 		 644 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.02 
 
 		 658 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.72 
 
 		 654 aa  657    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  54.62 
 
 		 638 aa  681    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.33 
 
 		 638 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  63.41 
 
 		 643 aa  775    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  59.78 
 
 		 633 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  51.52 
 
 		 655 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  65.94 
 
 		 640 aa  827    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  53.38 
 
 		 654 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 		 647 aa  693    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  66.41 
 
 		 650 aa  842    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  67.19 
 
 		 640 aa  830    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  53.38 
 
 		 654 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  66.1 
 
 		 640 aa  828    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  66.1 
 
 		 640 aa  828    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  53.53 
 
 		 654 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  66.1 
 
 		 640 aa  828    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  53.53 
 
 		 654 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  56.29 
 
 		 635 aa  707    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  54.05 
 
 		 649 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  65.63 
 
 		 640 aa  818    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  53.53 
 
 		 654 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  53.65 
 
 		 655 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.78 
 
 		 655 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 655 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  53.22 
 
 		 654 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.36 
 
 		 645 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.51 
 
 		 636 aa  677    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.4 
 
 		 655 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.78 
 
 		 641 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  59.72 
 
 		 633 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  65.16 
 
 		 640 aa  809    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  55.68 
 
 		 645 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  53.53 
 
 		 654 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  62.68 
 
 		 640 aa  750    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  55.11 
 
 		 645 aa  670    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  53.29 
 
 		 656 aa  641    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  53.51 
 
 		 644 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  52.57 
 
 		 655 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  54.29 
 
 		 637 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 		 655 aa  652    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.51 
 
 		 636 aa  677    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  53.94 
 
 		 637 aa  692    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 649 aa  1337    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  66.1 
 
 		 640 aa  828    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  53.53 
 
 		 654 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  52.28 
 
 		 655 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  55.36 
 
 		 645 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 		 634 aa  686    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  60.06 
 
 		 642 aa  726    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.43 
 
 		 644 aa  677    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.43 
 
 		 634 aa  731    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.99 
 
 		 665 aa  685    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  52.43 
 
 		 674 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  51.26 
 
 		 675 aa  666    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 		 645 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  66.25 
 
 		 640 aa  833    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  59.91 
 
 		 638 aa  740    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  59.65 
 
 		 644 aa  749    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.3 
 
 		 632 aa  736    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.34 
 
 		 641 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 655 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.59 
 
 		 636 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.4 
 
 		 642 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  65.63 
 
 		 640 aa  818    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.18 
 
 		 656 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  55.03 
 
 		 635 aa  666    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54.49 
 
 		 644 aa  695    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.05 
 
 		 642 aa  670    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  53.22 
 
 		 654 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  54.73 
 
 		 652 aa  690    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  61.1 
 
 		 638 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  61.26 
 
 		 638 aa  710    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  66.1 
 
 		 640 aa  828    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  52.35 
 
 		 650 aa  682    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  58.15 
 
 		 633 aa  749    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  52.65 
 
 		 653 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  55.19 
 
 		 627 aa  649    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  65.64 
 
 		 651 aa  832    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  52.12 
 
 		 644 aa  636    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  67.55 
 
 		 652 aa  877    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  53.38 
 
 		 654 aa  651    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  73.74 
 
 		 655 aa  914    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.21 
 
 		 642 aa  723    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  71.83 
 
 		 672 aa  905    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.23 
 
 		 651 aa  669    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  51.17 
 
 		 649 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  66.67 
 
 		 650 aa  836    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.77 
 
 		 634 aa  644    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  59.08 
 
 		 628 aa  750    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  56.99 
 
 		 650 aa  738    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.59 
 
 		 640 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  53.22 
 
 		 654 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  54.01 
 
 		 643 aa  676    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 		 643 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>