More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2894 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  100 
 
 
458 aa  890  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  100 
 
 
458 aa  890  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  37.14 
 
 
465 aa  216  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  33.11 
 
 
476 aa  216  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
465 aa  216  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  33.63 
 
 
459 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  31.75 
 
 
452 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  31.44 
 
 
438 aa  189  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  29.98 
 
 
480 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  30.88 
 
 
445 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  35.25 
 
 
464 aa  184  4e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  31.61 
 
 
499 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
474 aa  182  8e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.67 
 
 
471 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  30 
 
 
471 aa  181  3e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  29.29 
 
 
467 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  32.86 
 
 
468 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  32.86 
 
 
468 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  32.62 
 
 
468 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  32.86 
 
 
468 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  32.62 
 
 
468 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  33.17 
 
 
443 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  33.02 
 
 
427 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  33.17 
 
 
443 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  33.17 
 
 
443 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  33.17 
 
 
443 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  33.17 
 
 
443 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  33.17 
 
 
443 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
443 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  33.17 
 
 
443 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  30.56 
 
 
463 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  30.8 
 
 
469 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  29.3 
 
 
443 aa  162  8e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
477 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  31.54 
 
 
458 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  29.3 
 
 
441 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  31.74 
 
 
442 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  31.51 
 
 
442 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  31.18 
 
 
442 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.27 
 
 
446 aa  154  3e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  32.27 
 
 
465 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  31.71 
 
 
473 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
423 aa  150  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  29.38 
 
 
480 aa  149  1e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  31.25 
 
 
473 aa  148  2e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
508 aa  148  2e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  26.54 
 
 
446 aa  146  8e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  32.04 
 
 
442 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  31.14 
 
 
458 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  29.22 
 
 
477 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.06 
 
 
441 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.43 
 
 
477 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2048  sugar transporter  30.02 
 
 
478 aa  142  1e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  28.93 
 
 
475 aa  142  1e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  30.28 
 
 
493 aa  141  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  28.83 
 
 
471 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.49242e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  31 
 
 
443 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  28.37 
 
 
434 aa  136  7e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  31.22 
 
 
507 aa  136  7e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.84 
 
 
457 aa  136  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  31.07 
 
 
468 aa  135  1e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  30.48 
 
 
442 aa  135  1e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  29.83 
 
 
457 aa  135  2e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.76 
 
 
454 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
460 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  31.09 
 
 
460 aa  133  7e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  27.59 
 
 
474 aa  132  1e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.21 
 
 
457 aa  132  1e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  28.27 
 
 
453 aa  132  1e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  28.09 
 
 
441 aa  131  2e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  29.79 
 
 
442 aa  131  2e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.05 
 
 
438 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  28.99 
 
 
459 aa  130  5e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  30.41 
 
 
473 aa  129  9e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  27.8 
 
 
439 aa  129  1e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  30.2 
 
 
468 aa  129  2e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  28.68 
 
 
496 aa  128  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  28.51 
 
 
442 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  8.23269e-06 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
446 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.04713e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  27.13 
 
 
444 aa  127  4e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
438 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.72 
 
 
447 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
456 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
467 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.15 
 
 
468 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
467 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  31.17 
 
 
473 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.6 
 
 
452 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  28.66 
 
 
497 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.6 
 
 
452 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.6 
 
 
452 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.92 
 
 
447 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.94 
 
 
437 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  29.21 
 
 
489 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  29.21 
 
 
489 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  29.21 
 
 
489 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  26.59 
 
 
480 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.1 
 
 
526 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.27 
 
 
492 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  33.19 
 
 
482 aa  122  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>