More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2832 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 768 aa  1561    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 768 aa  1561    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 778 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  33.51 
 
 		 778 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 824 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 799 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 773 aa  150  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 773 aa  150  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  22.37 
 
 		 768 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 768 aa  111  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 777 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  23.4 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 801 aa  84  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 799 aa  77.4  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 799 aa  73.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 777 aa  73.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25.52 
 
 		 760 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  26.52 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  25.75 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 819 aa  70.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 747 aa  70.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 790 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 777 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 765 aa  65.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  23.08 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 799 aa  64.7  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  21.3 
 
 		 744 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  21.55 
 
 		 744 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 715 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 737 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 779 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 776 aa  63.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  23.19 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 720 aa  62  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 768 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 819 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 724 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  22.34 
 
 		 769 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 766 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  20.55 
 
 		 744 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.11 
 
 		 914 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.01 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 841 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  23.91 
 
 		 807 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  21.2 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 736 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  26.51 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  24.63 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 772 aa  58.9  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.7 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 792 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.73 
 
 		 774 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 715 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 786 aa  57  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 765 aa  57.4  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 942 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 796 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 774 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 771 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 727 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 736 aa  55.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 790 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  27.55 
 
 		 797 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 720 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 723 aa  54.7  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  20.86 
 
 		 781 aa  54.7  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 		 739 aa  54.7  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 809 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 741 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 825 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 821 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 835 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 720 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 738 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>