153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2551 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1558    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 801 aa  1560    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  59.4 
 
 		 819 aa  866    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  44.18 
 
 		 787 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  44.18 
 
 		 787 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 799 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 799 aa  488  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  38.55 
 
 		 550 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 773 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 773 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 779 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  38.56 
 
 		 244 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 768 aa  84.7  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 768 aa  84.7  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  27.32 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 803 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 694 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 742 aa  60.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 777 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 783 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 719 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 506 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 711 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 732 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 708 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  19.46 
 
 		 720 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 727 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 751 aa  54.7  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.9 
 
 		 718 aa  54.3  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.95 
 
 		 857 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.81 
 
 		 728 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 688 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 743 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 779 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 747 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 763 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 706 aa  53.5  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  21.63 
 
 		 693 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 860 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 690 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  21.7 
 
 		 749 aa  52.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 703 aa  52.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 775 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.74 
 
 		 859 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 768 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 704 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 729 aa  51.6  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 779 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 736 aa  52  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 701 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 758 aa  51.6  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 743 aa  51.2  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 729 aa  51.2  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 759 aa  50.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 742 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 690 aa  50.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 726 aa  50.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 864 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 764 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 730 aa  49.7  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 785 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 790 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  22.57 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 755 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  22.12 
 
 		 768 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 724 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 737 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 702 aa  48.9  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  21.81 
 
 		 712 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  22.22 
 
 		 797 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 743 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 765 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 708 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 743 aa  48.5  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 239 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 756 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 803 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 786 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 802 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 755 aa  48.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  20.92 
 
 		 688 aa  48.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 809 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 743 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 743 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 796 aa  47.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 722 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  21.34 
 
 		 711 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.51 
 
 		 685 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 810 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 735 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  19.63 
 
 		 742 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 784 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 751 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 758 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>