21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2529 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  783    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  783    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  86.81 
 
 		 404 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  87.03 
 
 		 347 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  57.45 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  54.16 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  54.16 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  42.71 
 
 		 425 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  42.71 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  42.71 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  42.19 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  39.24 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  39.07 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  37.77 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  37.77 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  37.77 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  35.7 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  32.34 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  35.43 
 
 		 403 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  30.94 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1713  hypothetical protein  31.36 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000607675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>