45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2460 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 		 568 aa  1179    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  100 
 
 		 568 aa  1179    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  51.42 
 
 		 566 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  53.35 
 
 		 582 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  50.35 
 
 		 577 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  48.16 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  46.99 
 
 		 570 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  49.04 
 
 		 580 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  46.32 
 
 		 551 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  48.28 
 
 		 584 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  46.07 
 
 		 580 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  46.26 
 
 		 575 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  46.01 
 
 		 574 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  40.36 
 
 		 728 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  39.75 
 
 		 729 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 		 732 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  39.68 
 
 		 728 aa  352  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  36.89 
 
 		 726 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  36.89 
 
 		 726 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  36.72 
 
 		 726 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 		 734 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 		 731 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  37.9 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  39.38 
 
 		 695 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  36.64 
 
 		 749 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  34.38 
 
 		 674 aa  327  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  36.64 
 
 		 749 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 722 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  33.87 
 
 		 1042 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  36.67 
 
 		 747 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  36.14 
 
 		 744 aa  319  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  36.38 
 
 		 759 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  35.89 
 
 		 744 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  33.52 
 
 		 829 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  37.18 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 1162 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 1022 aa  192  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 1006 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  25.04 
 
 		 994 aa  162  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 1000 aa  159  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 1187 aa  67.4  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  22.52 
 
 		 902 aa  62.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 		 606 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  24.63 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>