More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2456 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  53.14 
 
 		 311 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  53.14 
 
 		 311 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54 
 
 		 303 aa  351  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  51.8 
 
 		 310 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  54.21 
 
 		 308 aa  346  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.8 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  53.87 
 
 		 309 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.88 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.62 
 
 		 315 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  52.96 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.08 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  52.88 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.02 
 
 		 304 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  53.33 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.43 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  51.92 
 
 		 311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  51.92 
 
 		 311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  52.09 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  55.52 
 
 		 310 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  51.68 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  53.72 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  52.48 
 
 		 305 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.85 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  52.67 
 
 		 303 aa  328  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  52.28 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  54.36 
 
 		 304 aa  325  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.36 
 
 		 304 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  52.07 
 
 		 309 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  47.72 
 
 		 367 aa  291  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.39 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  44.97 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  44.33 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  44.33 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  43.99 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  46.51 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.33 
 
 		 309 aa  268  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.7 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  46.21 
 
 		 427 aa  263  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  46.48 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  42.43 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  44.77 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  43.36 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  47 
 
 		 311 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  39.81 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  39.81 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  39.81 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  39.81 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  42.66 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  43.4 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  43.4 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  43.4 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  42.81 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  43.4 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.81 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  43.99 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  43.06 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  45.36 
 
 		 317 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  38.83 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.46 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.46 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.45 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.87 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.54 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.87 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  42.01 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  41.61 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  41.37 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.54 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.54 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  41.61 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  44.53 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  40.97 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  45.74 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.01 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.45 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  40.97 
 
 		 327 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.36 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  38 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  37.54 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  37.54 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  37.74 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  37.54 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  37.54 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.1 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  38.87 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  38.87 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  39.4 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  38.56 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  37.58 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  38.83 
 
 		 369 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  36.93 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>