30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2394 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2394    100 
 
 		 2937 bp  5822    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2179    100 
 
 		 2775 bp  4056    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  decreased coverage  0.00000000127376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1126    100 
 
 		 3378 bp  4054    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  100 
 
 		 882 bp  1513    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  86.27 
 
 		 876 bp  137  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  85.26 
 
 		 876 bp  127  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2799  hypothetical protein  100 
 
 		 810 bp  123  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  100 
 
 		 969 bp  121  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  82.8 
 
 		 873 bp  97.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 3999 bp  93.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  82.78 
 
 		 876 bp  93.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  79.39 
 
 		 876 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  83.21 
 
 		 870 bp  89.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.71 
 
 		 876 bp  83.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  81.41 
 
 		 855 bp  79.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  81.75 
 
 		 879 bp  73.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  80.65 
 
 		 879 bp  69.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.19 
 
 		 882 bp  65.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  80.39 
 
 		 876 bp  65.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  86.76 
 
 		 852 bp  63.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.42 
 
 		 840 bp  61.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 843 bp  58  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  83.13 
 
 		 876 bp  54  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  81.63 
 
 		 840 bp  52  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  90.48 
 
 		 855 bp  52  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  90.48 
 
 		 855 bp  52  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  90.48 
 
 		 852 bp  52  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  85.25 
 
 		 840 bp  50.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  79.56 
 
 		 882 bp  50.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  79.56 
 
 		 882 bp  50.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>