80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2346 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2346  Putative lipid carrier protein-like protein  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.429272  hitchhiker  0.0000140967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2724  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.342015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  33.79 
 
 
227 aa  88.2  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2183  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  unclonable  0.000000231276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0819  Sterol-binding domain protein  35.43 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0595  Sterol-binding domain protein  39.25 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1806  hypothetical protein  45.36 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3594  sterol-binding domain-containing protein  39.8 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820856  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3714  sterol-binding domain-containing protein  41.86 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3580  SCP-2 sterol transfer family protein  41.86 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4011  SCP-2 sterol transfer family protein  41.86 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2747  hypothetical protein  44.33 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3455  Sterol-binding domain protein  34.78 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.330652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2812  hypothetical protein  43.3 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2690  hypothetical protein  43.3 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2387  hypothetical protein  43.3 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3615  sterol-binding protein  39.53 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2575  Sterol-binding domain protein  43.75 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0505  sterol-binding domain-containing protein  36.73 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3222  hypothetical protein  37.23 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1197  hypothetical protein  36.23 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1702  hypothetical protein  42.71 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.871926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2900  hypothetical protein  42.71 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.272152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3639  sterol-binding protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0548  Sterol-binding domain protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4476  sterol-binding protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3628  sterol-binding protein  36.73 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.446971  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03386  hypothetical protein  41.05 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3349  sterol-binding protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3531  sterol-binding protein  36.73 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3460  sterol-binding protein  36.73 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3462  sterol-binding protein  36.73 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3568  sterol-binding protein  36.73 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0541  sterol-binding domain-containing protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02975  hypothetical protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3452  sterol-binding protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03024  predicted lipid carrier protein  38.37 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13320  hypothetical protein  36.23 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.3654  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0185  hypothetical protein  44.44 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002620  putative lipid carrier protein  40 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0134  hypothetical protein  38.24 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2129  SCP-2 sterol transfer family protein  33.33 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3336  Sterol-binding domain protein  36.27 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0607  hypothetical protein  38.1 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0715  Sterol-binding domain protein  40.95 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3090  sterol-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2786  sterol-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2134  hypothetical protein  36.22 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0999  hypothetical protein  36.44 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3018  sterol-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2067  sterol-binding domain-containing protein  38.64 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3349  hypothetical protein  35.14 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1040  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1066  sterol-binding domain-containing protein  33.04 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3515  sterol-binding domain-containing protein  31.21 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03865  putative lipid carrier protein  32.98 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1015  hypothetical protein  39.05 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1032  sterol-binding domain-containing protein  36.8 
 
 
154 aa  58.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.266214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1062  sterol-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1134  sterol-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2804  sterol-binding domain-containing protein  32.41 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02299  hypothetical protein  37.36 
 
 
143 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.394497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1250  hypothetical protein  32.17 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1172  Sterol-binding domain protein  31.58 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3195  sterol-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
177 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3201  sterol-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
177 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0107  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3339  sterol-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1472  sterol-binding domain-containing protein  40.45 
 
 
155 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4662  hypothetical protein  34.94 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4938  hypothetical protein  34.26 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3585  hypothetical protein  34.94 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.837033  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1787  hypothetical protein  34.12 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.017366  normal  0.582265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2111  hypothetical protein  34.12 
 
 
141 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342906  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5058  hypothetical protein  35.71 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  38.81 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  38.81 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  38.81 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.74 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.74 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>