71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2343 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2721  lipoate-protein ligase A, putative  100 
 
 		 510 aa  1070    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2343  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 510 aa  1070    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855949  hitchhiker  0.000773035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.75 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1549  CO dehydrogenase beta subunit/acetyl-CoA synthase epsilon subunit  26.46 
 
 		 667 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  25.58 
 
 		 363 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.4 
 
 		 360 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  31.91 
 
 		 356 aa  96.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.91 
 
 		 356 aa  96.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.08 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.92 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.43 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.9 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.14 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.84 
 
 		 349 aa  57  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.38 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.92 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.92 
 
 		 267 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  25.95 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  22.95 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.73 
 
 		 261 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 		 349 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.4 
 
 		 327 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  24.75 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  19.9 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  21.05 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.12 
 
 		 280 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.2 
 
 		 329 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.53 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  22.45 
 
 		 345 aa  50.8  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  21.76 
 
 		 334 aa  51.2  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.48 
 
 		 366 aa  50.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.64 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  25.17 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  23.78 
 
 		 336 aa  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  20.58 
 
 		 326 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  25.85 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  31.63 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.13 
 
 		 275 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.6 
 
 		 354 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.22 
 
 		 325 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  24.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 340 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 340 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.49 
 
 		 329 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  21.82 
 
 		 333 aa  47.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  23.31 
 
 		 325 aa  47  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.35 
 
 		 329 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  22.3 
 
 		 339 aa  47  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  18.92 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  20.23 
 
 		 364 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.27 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  22.16 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.35 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.16 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.16 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.27 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  19.89 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.68 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.09 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  25.95 
 
 		 253 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0648  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.98 
 
 		 348 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  0.0871201 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  22.39 
 
 		 329 aa  43.9  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>