240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2299 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  100 
 
 		 598 aa  1224    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 598 aa  1224    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  52.85 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  48.21 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  51.04 
 
 		 607 aa  525  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.92 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.69 
 
 		 615 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.78 
 
 		 597 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.71 
 
 		 616 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.01 
 
 		 620 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.44 
 
 		 616 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  41.6 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.88 
 
 		 616 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  41.54 
 
 		 664 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  41.6 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  41.37 
 
 		 617 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.85 
 
 		 617 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.81 
 
 		 622 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  41.71 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  41.71 
 
 		 619 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.05 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.02 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  40.68 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.76 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  39.41 
 
 		 571 aa  432  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.53 
 
 		 601 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  40.85 
 
 		 625 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  40.2 
 
 		 634 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  40.82 
 
 		 620 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.78 
 
 		 625 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  40.91 
 
 		 611 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  40.14 
 
 		 625 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  41.65 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  40.2 
 
 		 632 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  41.27 
 
 		 606 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  37.89 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.65 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.2 
 
 		 627 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  39.76 
 
 		 626 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  38.97 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  39.41 
 
 		 607 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.66 
 
 		 638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.43 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  36.52 
 
 		 573 aa  403  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  38.14 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.84 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.25 
 
 		 591 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  35.57 
 
 		 573 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.26 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  37.5 
 
 		 612 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.13 
 
 		 589 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.99 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  36.49 
 
 		 573 aa  382  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  36.14 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  36.14 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  33.39 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.56 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.83 
 
 		 603 aa  339  9e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.79 
 
 		 584 aa  300  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  35.26 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.47 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.68 
 
 		 578 aa  286  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.84 
 
 		 597 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  29.38 
 
 		 577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.14 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  30.22 
 
 		 619 aa  207  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.75 
 
 		 582 aa  197  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  29.09 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  25.55 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  30.43 
 
 		 600 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  25.89 
 
 		 592 aa  189  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.29 
 
 		 594 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.6 
 
 		 584 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  26.75 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  29.66 
 
 		 587 aa  185  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  28.9 
 
 		 603 aa  184  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.44 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  28.13 
 
 		 605 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.44 
 
 		 603 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  25.08 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  24.56 
 
 		 595 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  24.79 
 
 		 604 aa  177  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  26.63 
 
 		 604 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.39 
 
 		 607 aa  177  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.22 
 
 		 612 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  25.55 
 
 		 599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  26.87 
 
 		 601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  25.38 
 
 		 601 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 		 608 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  27.76 
 
 		 599 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  28.51 
 
 		 609 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  27.76 
 
 		 599 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  25.42 
 
 		 600 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  24.59 
 
 		 606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  25.21 
 
 		 608 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  26.52 
 
 		 607 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  25.21 
 
 		 608 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 		 608 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 		 608 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>