More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2263 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  68.43 
 
 
486 aa  652  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
481 aa  967  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  9.3987e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  100 
 
 
481 aa  967  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  67.92 
 
 
483 aa  642  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.32 
 
 
496 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  69.05 
 
 
481 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.11 
 
 
496 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  68.34 
 
 
486 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  63.41 
 
 
480 aa  624  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.25 
 
 
481 aa  624  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  67.98 
 
 
481 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  63.41 
 
 
480 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.38 
 
 
496 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  65.5 
 
 
485 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.29 
 
 
485 aa  618  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.3 
 
 
487 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.88 
 
 
487 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  65.21 
 
 
481 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  64.24 
 
 
481 aa  614  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  1.44333e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.11 
 
 
481 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  67.3 
 
 
498 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  66.32 
 
 
491 aa  615  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  66.81 
 
 
486 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.08 
 
 
490 aa  608  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.58 
 
 
486 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  64.58 
 
 
486 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.96 
 
 
508 aa  606  1e-172  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  69.92 
 
 
490 aa  607  1e-172  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  64.38 
 
 
493 aa  602  1e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.49 
 
 
487 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.38 
 
 
486 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  66.11 
 
 
488 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.32 
 
 
486 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  64.79 
 
 
486 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  64.11 
 
 
487 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.69 
 
 
488 aa  598  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.64 
 
 
490 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.26 
 
 
479 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.48 
 
 
488 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.67 
 
 
480 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  65.05 
 
 
479 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.05 
 
 
479 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.05 
 
 
479 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  63.37 
 
 
484 aa  591  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.24 
 
 
479 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  64.39 
 
 
482 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.01 
 
 
488 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.36 
 
 
480 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  64.86 
 
 
498 aa  583  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  64.86 
 
 
498 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  64.86 
 
 
498 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3290  TldD/PmbA family protein  64.86 
 
 
498 aa  582  1e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  61.59 
 
 
481 aa  584  1e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  64.86 
 
 
498 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  64.86 
 
 
498 aa  583  1e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  64.86 
 
 
498 aa  583  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  65.25 
 
 
480 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  64.6 
 
 
488 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.6 
 
 
493 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.06 
 
 
488 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.27 
 
 
488 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.06 
 
 
488 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  64.53 
 
 
480 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.27 
 
 
488 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.06 
 
 
512 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  65.74 
 
 
480 aa  575  1e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  66.45 
 
 
479 aa  577  1e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  2.06078e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  62.39 
 
 
497 aa  572  1e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  62.61 
 
 
497 aa  573  1e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  58 
 
 
481 aa  573  1e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.53 
 
 
482 aa  572  1e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  60.93 
 
 
490 aa  571  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  62.39 
 
 
497 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  61.59 
 
 
481 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.56 
 
 
481 aa  565  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.67 
 
 
482 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  59.71 
 
 
481 aa  564  1e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  61.38 
 
 
481 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  61.38 
 
 
481 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  61.38 
 
 
481 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  61.38 
 
 
481 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.52 
 
 
480 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  59.71 
 
 
481 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  64.47 
 
 
480 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  58.87 
 
 
481 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.66 
 
 
481 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  59.92 
 
 
481 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  59.71 
 
 
481 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.1 
 
 
482 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.1 
 
 
482 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.1 
 
 
482 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.82 
 
 
482 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  59.71 
 
 
481 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  60.46 
 
 
481 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>