More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2223 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.66 
 
 
201 aa  280  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  64.04 
 
 
203 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  63 
 
 
201 aa  269  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.59 
 
 
203 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  58.5 
 
 
201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  58.5 
 
 
201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  58.5 
 
 
201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  61 
 
 
202 aa  251  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.9 
 
 
216 aa  249  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  58.13 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  57.43 
 
 
204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.94 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  57 
 
 
201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  57.92 
 
 
202 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  56.86 
 
 
204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  55.94 
 
 
204 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.93 
 
 
202 aa  235  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  55.45 
 
 
202 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  56.93 
 
 
202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  228  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  52.5 
 
 
201 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  53.73 
 
 
201 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.74 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  53.47 
 
 
204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  52.71 
 
 
206 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  50.5 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  53 
 
 
204 aa  214  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  48 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.51 
 
 
205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 
201 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  53 
 
 
201 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  49 
 
 
202 aa  198  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  46 
 
 
202 aa  197  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  49 
 
 
204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  49.5 
 
 
204 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  45 
 
 
202 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  48.22 
 
 
202 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.8 
 
 
210 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  46.39 
 
 
196 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  47.14 
 
 
218 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.14 
 
 
210 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 
211 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.14 
 
 
210 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  48.28 
 
 
206 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 
210 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 
227 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  46.6 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  47.76 
 
 
227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  47.26 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  48.79 
 
 
206 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  42.79 
 
 
201 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  42.79 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  44.06 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  45.77 
 
 
202 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  45.27 
 
 
205 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  43.07 
 
 
209 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  45.81 
 
 
201 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  44.06 
 
 
203 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.28 
 
 
201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  45.32 
 
 
201 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.68 
 
 
211 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  44.78 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.18 
 
 
207 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  43.5 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  38.65 
 
 
206 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  38.5 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  39.3 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  37.68 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.06 
 
 
227 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 
204 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  31.68 
 
 
205 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  33.81 
 
 
217 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  34.15 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  37.68 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.89 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  38.1 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
206 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  38.05 
 
 
205 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2900  putative glutathionine S-transferase  39.88 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
217 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  33.66 
 
 
206 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
205 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.97 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  31.88 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>