175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2181 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2181  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  2.68633e-10 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1127  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.418857  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1766  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.398767  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1511  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.673335  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0304  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0856099  hitchhiker  0.00019889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1209  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  3.67685e-07 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0945  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0737  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  6.64459e-10 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0308  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00145188  decreased coverage  1.98477e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0201  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0150  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0118  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2081  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2426  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.67588  hitchhiker  0.000659756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2580  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2772  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2396  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2789  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2330  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2135  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0139526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2798  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2130  transposase, IS4  100 
 
 
104 aa  217  4e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0125473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  48.91 
 
 
390 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  48.91 
 
 
390 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  48.91 
 
 
390 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2058  hypothetical protein  44.79 
 
 
173 aa  80.5  7e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00443479  normal  0.186203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  52.63 
 
 
409 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  52.63 
 
 
433 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  43.48 
 
 
395 aa  76.6  1e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  42.27 
 
 
415 aa  70.9  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  42.27 
 
 
437 aa  70.9  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  43.84 
 
 
395 aa  68.6  3e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  42.47 
 
 
395 aa  66.2  1e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  48.68 
 
 
401 aa  64.7  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  44.58 
 
 
483 aa  64.7  4e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  48.68 
 
 
401 aa  64.7  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  42.11 
 
 
310 aa  63.5  8e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  36.46 
 
 
396 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  36.46 
 
 
396 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  36.46 
 
 
396 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  36.46 
 
 
396 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  36.46 
 
 
396 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  36.46 
 
 
396 aa  61.6  3e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  37.18 
 
 
404 aa  61.2  5e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  39.77 
 
 
390 aa  58.5  3e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  44.26 
 
 
367 aa  58.5  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2798  hypothetical protein  38.14 
 
 
375 aa  58.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1741  hypothetical protein  38.14 
 
 
366 aa  58.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796927  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3396  hypothetical protein  38.14 
 
 
375 aa  58.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0121  hypothetical protein  38.14 
 
 
375 aa  58.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.474762  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3492  hypothetical protein  38.14 
 
 
375 aa  58.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1203  hypothetical protein  38.14 
 
 
375 aa  58.2  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.145898  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3310  ISMca6, transposase, OrfB  46.88 
 
 
152 aa  56.2  2e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1610  ISMca6, transposase, OrfB  39.78 
 
 
197 aa  55.1  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0032  ISMca6, transposase, OrfB  39.78 
 
 
197 aa  55.1  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  50 
 
 
367 aa  55.5  3e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6709  transposase, IS4 family protein  38 
 
 
352 aa  54.7  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2070  transposase, IS4  37.04 
 
 
369 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  47.83 
 
 
333 aa  50.8  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  47.83 
 
 
393 aa  50.4  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
372 aa  50.4  8e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1035  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0517087 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3409  hypothetical protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3025  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2914  transposase IS4 family protein  32 
 
 
378 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  1.04805e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0568  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0649979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
372 aa  50.1  9e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0808  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0635  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.124788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0630  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0989  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0186  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2126  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.537555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1729  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1696  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0465835  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2192  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1632  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1605  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0244388  normal  0.0207285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2411  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0641  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1099  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  50.4  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2671  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  50.1  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
372 aa  49.7  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
372 aa  49.7  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1989  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  48.9  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0275815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1967  transposase IS4 family protein  32 
 
 
363 aa  48.9  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0519059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4269  transposase IS4 family protein  32.88 
 
 
342 aa  48.5  3e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>