152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2173 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
356 aa  718  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  7.26509e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  100 
 
 
356 aa  718  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.99 
 
 
360 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  44.35 
 
 
363 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  42.14 
 
 
530 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.51 
 
 
343 aa  232  6e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  2.48179e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.43 
 
 
344 aa  179  5e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.83 
 
 
344 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  36.79 
 
 
245 aa  121  2e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  8.20504e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.74 
 
 
273 aa  110  4e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.15448e-08  unclonable  1.0218e-08 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.39 
 
 
327 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.35 
 
 
345 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.7 
 
 
366 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  27 
 
 
364 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.72 
 
 
261 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  30.46 
 
 
329 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.59 
 
 
329 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.14 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  25.85 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  25.85 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  28.75 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  25.85 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  25.85 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  28.75 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  25.85 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  29.95 
 
 
329 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  27.46 
 
 
326 aa  99.8  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.38 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.8 
 
 
329 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.77 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.36 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.83 
 
 
329 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2721  lipoate-protein ligase A, putative  31.91 
 
 
510 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2343  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.91 
 
 
510 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855949  hitchhiker  0.000773035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.05 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.58 
 
 
261 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.72 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  6.42263e-07 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  28.57 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  29.84 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  28.09 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.13 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  30.65 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.82 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.89692e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.82 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  5.25877e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  32.11 
 
 
253 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.44 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  29.81 
 
 
257 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.96 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.96 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  23.05 
 
 
276 aa  87  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  29.33 
 
 
336 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  30.86 
 
 
329 aa  87  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.6 
 
 
240 aa  86.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  31.71 
 
 
352 aa  85.5  1e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.78 
 
 
362 aa  85.9  1e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.69 
 
 
372 aa  85.1  2e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  29.61 
 
 
334 aa  84.3  3e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.75 
 
 
278 aa  83.6  5e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.82 
 
 
365 aa  83.6  5e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.78 
 
 
349 aa  83.2  6e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  29.34 
 
 
364 aa  82.8  8e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  33.13 
 
 
325 aa  82.8  8e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  27.86 
 
 
328 aa  82.8  8e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.81 
 
 
259 aa  82.4  1e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.27 
 
 
332 aa  81.3  2e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  33.33 
 
 
289 aa  81.6  2e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  30.95 
 
 
331 aa  81.3  2e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.7 
 
 
278 aa  81.3  3e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.7 
 
 
278 aa  81.3  3e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.62 
 
 
278 aa  80.5  4e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.3 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.3 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.62 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  28.89 
 
 
332 aa  80.1  5e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.3 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.3 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.3 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  24.3 
 
 
278 aa  80.1  6e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.3 
 
 
278 aa  80.1  6e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.9 
 
 
278 aa  80.1  6e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.56 
 
 
354 aa  79.3  8e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.58 
 
 
357 aa  79  1e-13  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  27.11 
 
 
349 aa  79  1e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  27.45 
 
 
247 aa  77.4  4e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  29.76 
 
 
338 aa  75.1  2e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.13 
 
 
358 aa  74.7  2e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.94 
 
 
266 aa  75.1  2e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.14 
 
 
338 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  29.95 
 
 
562 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  26.02 
 
 
345 aa  73.9  4e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.59 
 
 
349 aa  73.6  5e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  30.14 
 
 
338 aa  73.6  5e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  30.13 
 
 
331 aa  73.2  6e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  30.14 
 
 
338 aa  73.2  7e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  27.07 
 
 
334 aa  72.8  8e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.45 
 
 
276 aa  72.8  8e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  30.14 
 
 
338 aa  72.8  8e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  30.14 
 
 
338 aa  72.8  8e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  30.14 
 
 
338 aa  72.8  8e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  30.14 
 
 
338 aa  72.8  8e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>