259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2164 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  2.22341e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  99.63 
 
 
276 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.12 
 
 
286 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.43 
 
 
286 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.62 
 
 
267 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.61 
 
 
267 aa  332  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  58.65 
 
 
267 aa  332  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  61 
 
 
268 aa  332  4e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  60.69 
 
 
271 aa  332  5e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  61.72 
 
 
265 aa  329  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  58.58 
 
 
268 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  59.61 
 
 
269 aa  325  4e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  58.91 
 
 
267 aa  325  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  59.92 
 
 
268 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  59.77 
 
 
266 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  60.24 
 
 
267 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  60.24 
 
 
267 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  60.47 
 
 
279 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  61.54 
 
 
268 aa  322  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  58.46 
 
 
270 aa  323  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  61.57 
 
 
271 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  60.08 
 
 
307 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  58.53 
 
 
267 aa  321  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  58.59 
 
 
267 aa  316  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  60.62 
 
 
272 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  59.32 
 
 
278 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  58.27 
 
 
267 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  58.27 
 
 
267 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.81 
 
 
267 aa  313  2e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  58.69 
 
 
267 aa  313  2e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  58.08 
 
 
265 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  61.13 
 
 
272 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  58.2 
 
 
266 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  61.13 
 
 
272 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  58.37 
 
 
273 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  57.31 
 
 
284 aa  309  3e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  55.47 
 
 
285 aa  309  3e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  59.35 
 
 
268 aa  309  3e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  57.87 
 
 
275 aa  307  9e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  55.47 
 
 
266 aa  306  2e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  58.3 
 
 
272 aa  306  2e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  56.64 
 
 
260 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  57.71 
 
 
260 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  58.21 
 
 
270 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  59.53 
 
 
283 aa  305  4e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  59.53 
 
 
283 aa  305  4e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  59.53 
 
 
283 aa  305  4e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  56.59 
 
 
260 aa  304  1e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  59.14 
 
 
282 aa  303  2e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  59.14 
 
 
282 aa  303  2e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  59.14 
 
 
282 aa  303  2e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  55.86 
 
 
270 aa  302  5e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  53.41 
 
 
280 aa  301  8e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  58.27 
 
 
277 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  57.65 
 
 
273 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  56.69 
 
 
265 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  55.91 
 
 
265 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  55.91 
 
 
265 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  58.98 
 
 
282 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  59.14 
 
 
270 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  55.91 
 
 
268 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.86 
 
 
266 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.03 
 
 
271 aa  292  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.02 
 
 
270 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  57.03 
 
 
260 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.42 
 
 
270 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  56.63 
 
 
260 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.42 
 
 
270 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  54.37 
 
 
270 aa  286  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  54.62 
 
 
272 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  55.42 
 
 
269 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  53.52 
 
 
285 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  54.62 
 
 
270 aa  286  3e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  53.46 
 
 
279 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  52.63 
 
 
280 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  50.4 
 
 
267 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  49.39 
 
 
266 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  50.61 
 
 
267 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  50.61 
 
 
267 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  49.8 
 
 
267 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.78 
 
 
308 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  30.58 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  30.58 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.58 
 
 
263 aa  99  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.46 
 
 
291 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  30.48 
 
 
324 aa  81.3  1e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.17 
 
 
278 aa  81.6  1e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  25.96 
 
 
297 aa  79.7  4e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  25.53 
 
 
297 aa  80.1  4e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  25.96 
 
 
297 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.58877e-09 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  25.96 
 
 
297 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  25.96 
 
 
297 aa  79.7  4e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.53 
 
 
297 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70492e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  25.96 
 
 
297 aa  79.7  4e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.05 
 
 
290 aa  79.7  5e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.22684e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.53 
 
 
297 aa  79.3  6e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  25.53 
 
 
297 aa  79  7e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  25.96 
 
 
297 aa  79  8e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  27.78 
 
 
264 aa  79  9e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.53 
 
 
297 aa  77.8  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>