More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2156 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  51.64 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  49.75 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  50.95 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  49.75 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  53.62 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  54.4 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  47.37 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  51.96 
 
 		 216 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  46.45 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  49.76 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  46.45 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  46.45 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  46.45 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  49.76 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  47.62 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.62 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  45.97 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  48.42 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  46.05 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  47.85 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  48.57 
 
 		 213 aa  197  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  46.7 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  44.24 
 
 		 217 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  46.05 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  49.51 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  52.22 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  48.82 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  46.63 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  46.48 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  49.76 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  54.4 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  53.37 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  51.72 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  54.4 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  48.17 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  48.98 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  48.19 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  47.62 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  52 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  48.34 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  45.28 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  47.62 
 
 		 218 aa  187  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  46.6 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  47.52 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  45.87 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  49.76 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  45.79 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  47.8 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  43.06 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  47.8 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  46.38 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  47.06 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  47.06 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  46.83 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  43.38 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  45.59 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  45.75 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  44.24 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  46.67 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  48.1 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  41.06 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  46.23 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  46.23 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  46.23 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  43.69 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  43.5 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 		 223 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  42.5 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  46.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  46.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  46.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  46.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  46.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  44.39 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  46.05 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  46.76 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  46.76 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  44.13 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  42.86 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  46.07 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  49.07 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  42.38 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  45.63 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  38.86 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  46.27 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  46.27 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  44.17 
 
 		 257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  46.27 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  44.17 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>