96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2089 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1058    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 518 aa  1058    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  48.09 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  50.2 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  51.2 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  50.8 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  50.61 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  49.8 
 
 		 526 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  49.8 
 
 		 526 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  49.11 
 
 		 528 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  50.2 
 
 		 515 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  50 
 
 		 494 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.15 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.11 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.27 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.29 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  42.8 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  46.84 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  44.89 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.25 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  40.64 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  43.09 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  39.31 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  39.31 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  42.45 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  41.72 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  42.57 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  39.06 
 
 		 486 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  38.19 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  40.28 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  37.5 
 
 		 488 aa  339  9e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.52 
 
 		 335 aa  162  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.02 
 
 		 316 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.84 
 
 		 290 aa  157  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.21 
 
 		 316 aa  153  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.07 
 
 		 316 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.95 
 
 		 255 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.74 
 
 		 283 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  29.81 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.63 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.52 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  29.23 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.17 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.58 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.49 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  23.53 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.63 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.21 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.57 
 
 		 295 aa  55.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.47 
 
 		 281 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.19 
 
 		 294 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.32 
 
 		 296 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.11 
 
 		 310 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.44 
 
 		 287 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.98 
 
 		 324 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.1 
 
 		 450 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.5 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  24.23 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.64 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.35 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.28 
 
 		 281 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.62 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  25.75 
 
 		 340 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3083  glutathione synthetase  25.93 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224421  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  24.02 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.41 
 
 		 310 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.73 
 
 		 296 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.27 
 
 		 301 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  24.41 
 
 		 302 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 292 aa  47.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06030  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  26.23 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8462  normal  0.1627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  25.94 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.2 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  23.67 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  23.75 
 
 		 264 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.91 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  27.64 
 
 		 289 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  22.12 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1121  pyruvate carboxylase  31.91 
 
 		 1153 aa  45.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.4 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  23.4 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  21.19 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0947  putative acetyl/propionyl CoA carboxylase alpha subunit: biotin carboxylase  31.11 
 
 		 696 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0775564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  21.69 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  23.97 
 
 		 301 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2908  biotin carboxylation domain-containing protein  32.48 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.32 
 
 		 282 aa  43.5  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  21.33 
 
 		 1184 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  23.55 
 
 		 302 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  22.8 
 
 		 299 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.2 
 
 		 299 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  22.71 
 
 		 300 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.2 
 
 		 299 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.2 
 
 		 299 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  30 
 
 		 661 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>