More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2002 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  73.2 
 
 		 111 aa  153  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  75.79 
 
 		 106 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  75 
 
 		 109 aa  150  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  71.58 
 
 		 109 aa  149  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  70.53 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 98 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 102 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.53 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.08 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.2 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  42.35 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  39.08 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  39.33 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  34.07 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  36.08 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  36.26 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  38.75 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  35.79 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  35.44 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  35.44 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  34.41 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  33.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  36.05 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>