More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1997 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  43.41 
 
 
138 aa  119  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  47.33 
 
 
141 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.15 
 
 
142 aa  112  1e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  44.6 
 
 
140 aa  112  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  108  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 
144 aa  108  2e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
138 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  44.03 
 
 
135 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 
151 aa  107  7e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
141 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  43.88 
 
 
140 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  41.04 
 
 
135 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  41.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  44.64 
 
 
128 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  40.3 
 
 
135 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
138 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  42.54 
 
 
135 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 
135 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
144 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  35.21 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  39.84 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  37.04 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  38.52 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63421e-05 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  37.5 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03873e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 
141 aa  95.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  44.03 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  31.69 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  41.96 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  36.03 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  47.22 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
145 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
140 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  31.88 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  31.88 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  31.88 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  33.82 
 
 
141 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.82 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  39.81 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  32.09 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  36.61 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.23958e-05 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.12 
 
 
135 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
269 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  9.17613e-09 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  38.83 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.30588e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  45.1 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.37 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.39 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  37.4 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  32.79 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  37.19 
 
 
144 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  29.63 
 
 
148 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  34.38 
 
 
143 aa  82  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  82.4  2e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  34.38 
 
 
143 aa  82  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 
113 aa  82.4  2e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  7.9592e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  82.4  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
143 aa  82  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  50.59 
 
 
113 aa  82.4  2e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  34.38 
 
 
143 aa  82  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40 
 
 
132 aa  82.4  2e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
143 aa  82  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  37.31 
 
 
136 aa  82  3e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.38 
 
 
393 aa  80.9  6e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>