More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1990 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 435 aa  888    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 435 aa  888    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  62.24 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  62.7 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  62.94 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  62.94 
 
 		 431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  62.7 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  63.13 
 
 		 437 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  62.96 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  62.96 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  61.11 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  61.81 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  60.32 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  61.57 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  62.82 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  59.67 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  60.42 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  60.92 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  60.88 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  61.57 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  61.57 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  61.47 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 		 430 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  59.21 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  59.21 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  59.86 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  60 
 
 		 435 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  58.28 
 
 		 431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  57.93 
 
 		 435 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  57.7 
 
 		 435 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  60.23 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  61.11 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  58.1 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  57.47 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  58.62 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  58.16 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  58.1 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  57.93 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  59.22 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  58.1 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  58.66 
 
 		 450 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  57.85 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  57.01 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  59.63 
 
 		 439 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  59.45 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  57.11 
 
 		 431 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  58.29 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  58.16 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  59.45 
 
 		 439 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  59.08 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  57.58 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  55.01 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  58.68 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  60 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  57.41 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  53.97 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  57.86 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  55.48 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  54.44 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  54.1 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 435 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  56.64 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  54.44 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  54.33 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  58.43 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  57.54 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  55.71 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  53.16 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  54.08 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  53.7 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 435 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  55.71 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  52.57 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  54.31 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  53.61 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  54.44 
 
 		 431 aa  474  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  54.55 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 		 432 aa  477  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  52.09 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  56.64 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  54.78 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  55.01 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  54.78 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>