69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1937 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 773 aa  1569    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 773 aa  1569    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 787 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 787 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 787 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  40.56 
 
 		 550 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 799 aa  339  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 799 aa  324  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 801 aa  319  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 819 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 776 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 777 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 768 aa  150  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 768 aa  150  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  30.93 
 
 		 244 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 778 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  23.71 
 
 		 778 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 		 757 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 777 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 777 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 777 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 675 aa  55.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 777 aa  55.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 721 aa  55.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 755 aa  51.2  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 735 aa  50.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  21.39 
 
 		 768 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 777 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 747 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 799 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 768 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 824 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 787 aa  49.3  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.14 
 
 		 750 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 720 aa  48.5  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.24 
 
 		 633 aa  47.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 823 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  21.57 
 
 		 701 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.09 
 
 		 653 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  24.05 
 
 		 764 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  28.39 
 
 		 627 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 720 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 723 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.73 
 
 		 867 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  32.81 
 
 		 673 aa  46.6  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.44 
 
 		 618 aa  46.2  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  27.92 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  22.71 
 
 		 641 aa  45.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.96 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.78 
 
 		 862 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 780 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 786 aa  45.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.21 
 
 		 764 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 736 aa  44.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 753 aa  44.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 783 aa  44.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  20.73 
 
 		 701 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 781 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 786 aa  44.3  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>