More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1924 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 465 aa  915    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  100 
 
 		 465 aa  915    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  35.56 
 
 		 476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  33.71 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  33.93 
 
 		 445 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  33.05 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  34.6 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  37.36 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  37.36 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  32.68 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  32.28 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  33.41 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  33.19 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  34.78 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  30.89 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  34.55 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  36.44 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  31.4 
 
 		 480 aa  209  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  32.9 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  34.97 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  34.97 
 
 		 442 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  33.57 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  33.57 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  33.57 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  33.57 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  33.57 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  31.59 
 
 		 463 aa  199  9e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  31.26 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  33.18 
 
 		 468 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  33.18 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  33.18 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  33.18 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  33.18 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  34.51 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 427 aa  187  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  30.65 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.67 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  32.45 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  32.89 
 
 		 442 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  30.94 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  31.55 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  30.02 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  28.11 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  30.34 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.95 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.17 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  26.71 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  29.03 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  28.57 
 
 		 555 aa  146  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.95 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  30.56 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  30.56 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  29.43 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.84 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.82 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.34 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>