258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1855 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 357 aa  705    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 357 aa  705    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  29.75 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  31.21 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  31.71 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  26.84 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  27.04 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  26.29 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  28.12 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  28.12 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  25.35 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  25.07 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  26.05 
 
 		 354 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  25.35 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  29.5 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  25.63 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  29.61 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  29.67 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  27.67 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  28.33 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  27.71 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  29.15 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  26.33 
 
 		 370 aa  122  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  24.32 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  26.07 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  26.26 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  26.72 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  27.14 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  27.46 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  27.12 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  28.62 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  26.17 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  27.74 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  26.69 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.01 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  27.33 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  24.4 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  27.88 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  27.94 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  26.29 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  26.92 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  25.79 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  27.38 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  26.78 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  27.74 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  24.24 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  25.66 
 
 		 401 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  28.85 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  25.78 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0116  hypothetical protein  28.82 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0947899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  25.78 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  25.23 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  25.76 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  27.16 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  27.16 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  28.47 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  27.16 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  27.47 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  25.16 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  25.8 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  25.8 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>