More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1835 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  40.9 
 
 
932 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  40.19 
 
 
930 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
916 aa  1917    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  40.9 
 
 
927 aa  676    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  40.15 
 
 
928 aa  669    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  100 
 
 
909 aa  1901    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  35.89 
 
 
938 aa  546  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
812 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 
856 aa  211  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
805 aa  185  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 
805 aa  183  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  27.05 
 
 
1058 aa  154  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  26.77 
 
 
1058 aa  154  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  27.1 
 
 
1065 aa  152  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 
789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  37.2 
 
 
757 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 
1062 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  25.91 
 
 
981 aa  147  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  29.8 
 
 
876 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 
979 aa  144  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.13 
 
 
813 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02110  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.88 
 
 
806 aa  143  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292195  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 
800 aa  141  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  31.81 
 
 
784 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
978 aa  140  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  24.31 
 
 
969 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 
764 aa  138  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.43 
 
 
953 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  23.57 
 
 
978 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 
817 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
758 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 
698 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 
973 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 
973 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.68 
 
 
978 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.68 
 
 
978 aa  134  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.68 
 
 
973 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 
973 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  30.87 
 
 
730 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.66 
 
 
824 aa  133  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  32.53 
 
 
761 aa  132  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 
807 aa  132  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.55 
 
 
981 aa  132  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.59 
 
 
978 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.52 
 
 
973 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  23.59 
 
 
974 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  24.21 
 
 
974 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 
961 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 
804 aa  129  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 
760 aa  127  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.55 
 
 
836 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  31.13 
 
 
722 aa  126  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  32.54 
 
 
700 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.75 
 
 
864 aa  125  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  34.35 
 
 
756 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.54 
 
 
898 aa  123  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.52 
 
 
974 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 
760 aa  122  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 
760 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 
764 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 
764 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  31.86 
 
 
764 aa  120  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  31.86 
 
 
764 aa  120  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  32.18 
 
 
760 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  31.86 
 
 
764 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.02 
 
 
801 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  28.96 
 
 
758 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02507  hypothetical protein  22.97 
 
 
815 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 
807 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.13 
 
 
934 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  33.2 
 
 
754 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  28.28 
 
 
758 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.76 
 
 
839 aa  116  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  28.28 
 
 
758 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.95 
 
 
731 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  28.28 
 
 
758 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  28.28 
 
 
758 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.56 
 
 
826 aa  116  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 
760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  22.72 
 
 
808 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  31.49 
 
 
760 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.36 
 
 
1020 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  25.33 
 
 
932 aa  114  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  22.27 
 
 
781 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  25.76 
 
 
821 aa  114  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  22.01 
 
 
793 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 
936 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  23.47 
 
 
1087 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  32.31 
 
 
708 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  22.09 
 
 
837 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  26.01 
 
 
851 aa  114  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
800 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.22 
 
 
1020 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 
803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  22.11 
 
 
826 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  21.65 
 
 
814 aa  113  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  27.45 
 
 
910 aa  112  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 
911 aa  112  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 
729 aa  112  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>