More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1761 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  39.25 
 
 		 1040 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  39.18 
 
 		 1025 aa  693    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 		 1025 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  39.35 
 
 		 1040 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.16 
 
 		 1032 aa  855    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2217  multidrug efflux system subunit MdtB  39.35 
 
 		 1040 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3893  multidrug ABC transporter  38.54 
 
 		 1035 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  40.19 
 
 		 1041 aa  705    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  40.06 
 
 		 1033 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  44.54 
 
 		 1035 aa  879    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.51 
 
 		 1034 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.18 
 
 		 1035 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.94 
 
 		 1048 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  38.36 
 
 		 1034 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  39.01 
 
 		 1036 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 		 1035 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1029 aa  818    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  42.41 
 
 		 1040 aa  850    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  39.5 
 
 		 1046 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  39.58 
 
 		 1065 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  46.61 
 
 		 1023 aa  854    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  38.02 
 
 		 1044 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1032 aa  674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  39.9 
 
 		 1040 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.94 
 
 		 1048 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.17 
 
 		 1036 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.04 
 
 		 1048 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 		 1034 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  37.44 
 
 		 1035 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4662  acriflavin resistance protein  37.32 
 
 		 1033 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3933  multidrug resistance protein mdtB  40.52 
 
 		 1042 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.906804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  40.4 
 
 		 1037 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  42.5 
 
 		 1037 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1970  acriflavin resistance protein  40.29 
 
 		 1029 aa  715    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  39.98 
 
 		 1036 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.15 
 
 		 1048 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.87 
 
 		 1036 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1032 aa  666    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  45.41 
 
 		 1041 aa  825    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  41.93 
 
 		 1042 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 		 1037 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  40.39 
 
 		 1038 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  39.73 
 
 		 1024 aa  691    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  41.41 
 
 		 1041 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  40.94 
 
 		 1042 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 		 1034 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1044 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  40.02 
 
 		 1043 aa  693    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  38.79 
 
 		 1024 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.04 
 
 		 1048 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  39.49 
 
 		 1040 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  37.62 
 
 		 1048 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  37.56 
 
 		 1041 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  40.29 
 
 		 1041 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  41.9 
 
 		 1042 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  42.02 
 
 		 1042 aa  797    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  37.64 
 
 		 1037 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1597  acriflavin resistance protein  40.56 
 
 		 1044 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  38.59 
 
 		 1048 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  37.05 
 
 		 1032 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1042 aa  727    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  36.31 
 
 		 1096 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  40.14 
 
 		 1037 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3934  multidrug ABC transporter  36.03 
 
 		 1035 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.962709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  39.02 
 
 		 1051 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  38.83 
 
 		 1066 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  40.21 
 
 		 1069 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  38.5 
 
 		 1092 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  39.96 
 
 		 1032 aa  686    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1032 aa  854    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  40.13 
 
 		 1039 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  39.66 
 
 		 1043 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  40.1 
 
 		 1030 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 		 1032 aa  690    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2710  RND efflux transporter  40.18 
 
 		 1036 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  39.44 
 
 		 1025 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  38.27 
 
 		 1040 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0765  putative multidrug efflux protein  39.01 
 
 		 1026 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1039 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  39.66 
 
 		 1043 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  39.98 
 
 		 1036 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  38.45 
 
 		 1036 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2218  multidrug efflux system subunit MdtC  39.18 
 
 		 1025 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  40.13 
 
 		 1039 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  43.94 
 
 		 1055 aa  870    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4167  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1035 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  41.13 
 
 		 1029 aa  724    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 		 1036 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  39.88 
 
 		 1036 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  38.76 
 
 		 1065 aa  702    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  44.2 
 
 		 1041 aa  853    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2367  multidrug efflux system subunit MdtB  39.25 
 
 		 1040 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  42.97 
 
 		 1044 aa  817    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 		 1072 aa  691    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.94 
 
 		 1048 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  38.61 
 
 		 1051 aa  709    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0737  acriflavin resistance protein  39.24 
 
 		 1054 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1214  multidrug efflux system subunit MdtB  37.48 
 
 		 1052 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243575  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.94 
 
 		 1048 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.94 
 
 		 1048 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>