More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1737 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 
605 aa  1224  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 
605 aa  1224  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  8.52075e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.02 
 
 
629 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.6 
 
 
633 aa  334  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  36.38 
 
 
633 aa  332  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.83 
 
 
640 aa  317  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.35 
 
 
621 aa  311  3e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  36.44 
 
 
610 aa  306  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  1.53698e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.68 
 
 
626 aa  306  1e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  33.51 
 
 
621 aa  301  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.69 
 
 
617 aa  300  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.37439e-05  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.23 
 
 
637 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  33.15 
 
 
617 aa  297  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.58 
 
 
611 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  33.1 
 
 
616 aa  296  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.54 
 
 
616 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  33.33 
 
 
616 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.49898e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  33.75 
 
 
616 aa  293  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.63 
 
 
615 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.18784e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  33.39 
 
 
612 aa  292  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.17657e-06  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.39 
 
 
614 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.6932e-07  hitchhiker  1.82105e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  33.57 
 
 
616 aa  290  5e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.09 
 
 
614 aa  290  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.3501e-06  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.21 
 
 
614 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.03 
 
 
613 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  33.39 
 
 
616 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.32547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.76 
 
 
614 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.82 
 
 
613 aa  287  3e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.03 
 
 
613 aa  285  1e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.54581e-05  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.49 
 
 
661 aa  285  2e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.58 
 
 
615 aa  284  3e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.5558e-06  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.76 
 
 
615 aa  284  3e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.00228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.58 
 
 
615 aa  284  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  8.73335e-11 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.75 
 
 
620 aa  283  6e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.14 
 
 
617 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.76 
 
 
625 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.39 
 
 
615 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.44101e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  33.64 
 
 
618 aa  281  2e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  34 
 
 
618 aa  282  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  34.3 
 
 
618 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  6.40053e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  34.3 
 
 
618 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  34.3 
 
 
618 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.24959e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  34.3 
 
 
622 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.3 
 
 
618 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  34.3 
 
 
618 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  34.3 
 
 
618 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.09 
 
 
613 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.9404e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  34.12 
 
 
618 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  32.57 
 
 
618 aa  275  1e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 
617 aa  275  1e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  33.33 
 
 
618 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.82 
 
 
614 aa  270  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.33078e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  34.48 
 
 
618 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  33.33 
 
 
618 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  33.15 
 
 
618 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  33.33 
 
 
618 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  33.33 
 
 
618 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  35.93 
 
 
616 aa  266  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.06232e-06  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  35.55 
 
 
609 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  5.32675e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  35.73 
 
 
616 aa  263  7e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.07213e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  35.73 
 
 
616 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.94 
 
 
613 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.19 
 
 
587 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 
595 aa  240  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.5 
 
 
608 aa  236  1e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.9 
 
 
605 aa  234  4e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  32.29 
 
 
611 aa  233  7e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.81 
 
 
585 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.9 
 
 
598 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.9 
 
 
598 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.92 
 
 
590 aa  226  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  3.75913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.96 
 
 
604 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  33.26 
 
 
609 aa  222  2e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.97 
 
 
656 aa  217  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  31.06 
 
 
583 aa  217  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.65 
 
 
589 aa  216  1e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.85 
 
 
590 aa  214  4e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  31.29 
 
 
513 aa  210  7e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.6 
 
 
588 aa  197  4e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  31.08 
 
 
593 aa  194  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  28.74 
 
 
601 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.53 
 
 
595 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.96 
 
 
547 aa  189  9e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  30.47 
 
 
623 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.17 
 
 
597 aa  189  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 
593 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 
593 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 
593 aa  185  2e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  28.7 
 
 
601 aa  184  4e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.82 
 
 
563 aa  181  3e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.8 
 
 
566 aa  180  6e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.17 
 
 
594 aa  180  6e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.98 
 
 
596 aa  180  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.24 
 
 
595 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  29.13 
 
 
583 aa  176  1e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.93 
 
 
584 aa  174  3e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.52 
 
 
597 aa  174  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.16 
 
 
831 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  27.78 
 
 
569 aa  170  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.6 
 
 
649 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>