More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1688 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
394 aa  784  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1688  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
394 aa  784  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.19 
 
 
404 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0979  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.67 
 
 
476 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.67 
 
 
404 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2009  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.32 
 
 
400 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.67 
 
 
404 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.93 
 
 
404 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.93 
 
 
464 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.38 
 
 
404 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.12 
 
 
404 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.67 
 
 
404 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.67 
 
 
404 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2342  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.88 
 
 
404 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0158257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.36 
 
 
404 aa  492  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.14 
 
 
404 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.14 
 
 
404 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5661  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.35 
 
 
404 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541626  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.69 
 
 
399 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229559  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.62 
 
 
404 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.38 
 
 
393 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2358  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.09 
 
 
404 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739555  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2238  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.09 
 
 
404 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335743  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.7 
 
 
393 aa  474  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.95 
 
 
393 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.97 
 
 
400 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.87 
 
 
393 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.93 
 
 
393 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.93 
 
 
400 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.44 
 
 
401 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530276  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3291  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  64.4 
 
 
399 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.38 
 
 
393 aa  469  1e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.95 
 
 
400 aa  470  1e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0527923  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.38 
 
 
393 aa  468  1e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.3 
 
 
395 aa  465  1e-130  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.76 
 
 
393 aa  466  1e-130  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0775  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.02 
 
 
398 aa  466  1e-130  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.486774  normal  0.246438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.87 
 
 
393 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1966  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.97 
 
 
393 aa  464  1e-130  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.03 
 
 
413 aa  464  1e-130  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4258  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.21 
 
 
414 aa  467  1e-130  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0527  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.5 
 
 
590 aa  467  1e-130  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.44 
 
 
400 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2767  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.54 
 
 
393 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5252  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.45 
 
 
405 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426519  normal  0.758547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.18 
 
 
400 aa  459  1e-128  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2042  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.87 
 
 
392 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.489284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2037  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.87 
 
 
392 aa  460  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.2 
 
 
604 aa  459  1e-128  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.87 
 
 
392 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.13864e-07 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.56 
 
 
405 aa  460  1e-128  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.51 
 
 
393 aa  459  1e-128  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4943  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.67 
 
 
400 aa  458  1e-128  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1241  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.61 
 
 
392 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.17 
 
 
393 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.87 
 
 
393 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.61 
 
 
392 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.7 
 
 
393 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.61 
 
 
392 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.310007  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.7 
 
 
393 aa  454  1e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0558  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.34 
 
 
391 aa  454  1e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
391 aa  452  1e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.97 
 
 
393 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.97 
 
 
391 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.97 
 
 
391 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.97 
 
 
391 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.38 
 
 
393 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.13017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60 
 
 
392 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.76 
 
 
402 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.74 
 
 
392 aa  447  1e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3571  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.02 
 
 
401 aa  446  1e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3559  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.5 
 
 
408 aa  446  1e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0656478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.87 
 
 
392 aa  446  1e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.78447e-11  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.74 
 
 
392 aa  446  1e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2447  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.38 
 
 
393 aa  445  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1634  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.38 
 
 
393 aa  445  1e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60 
 
 
392 aa  447  1e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.74 
 
 
392 aa  446  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.74 
 
 
392 aa  445  1e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1255  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.47 
 
 
400 aa  447  1e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  60 
 
 
392 aa  447  1e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1001  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.46 
 
 
391 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.78 
 
 
393 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.74 
 
 
392 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
391 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.49 
 
 
392 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.87 
 
 
388 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.33 
 
 
391 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1092  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
391 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.78 
 
 
391 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2351  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.12 
 
 
393 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.46 
 
 
392 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3300  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.18 
 
 
391 aa  441  1e-122  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.5 
 
 
388 aa  439  1e-122  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.58 
 
 
392 aa  440  1e-122  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.51651e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1059  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.18 
 
 
391 aa  440  1e-122  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.26 
 
 
378 aa  440  1e-122  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0871  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.01 
 
 
391 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000494924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.85 
 
 
391 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000246757  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
392 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>