292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1680 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  100 
 
 
159 aa  330  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
159 aa  330  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.24 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.69 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  57.62 
 
 
152 aa  173  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.95 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.95 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2935  hypothetical protein  61.81 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  51.37 
 
 
156 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.94 
 
 
153 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.23 
 
 
153 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
153 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 
143 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  47.26 
 
 
145 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  47.26 
 
 
145 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.95 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.71 
 
 
153 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  49.64 
 
 
154 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.57 
 
 
145 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
154 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.75 
 
 
151 aa  133  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.86 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  52.76 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
145 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
159 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
159 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
143 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.36 
 
 
152 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.57 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  47.06 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  47.06 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  47.06 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  47.06 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  47.06 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  50.38 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.77 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  43.45 
 
 
149 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.86 
 
 
145 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.32 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  47.66 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.14 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.59 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.14 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.07 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.57 
 
 
145 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.57 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.06 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.38 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.57 
 
 
145 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.84 
 
 
153 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  41.33 
 
 
162 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
158 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 
159 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.61 
 
 
143 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
159 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  42.11 
 
 
157 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.14 
 
 
145 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
145 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  40 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
157 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.07 
 
 
163 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
150 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 
145 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
149 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.31 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
149 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.73 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  38.97 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.61 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.55 
 
 
147 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.22 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.61 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.61 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>