More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1659 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  69.68 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 		 158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 157 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  64.71 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 		 172 aa  200  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  64.24 
 
 		 155 aa  199  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  64.71 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  63.64 
 
 		 163 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 159 aa  197  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  64.05 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  65.36 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 153 aa  187  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  57.24 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  52.98 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  52.32 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  50.66 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 156 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  49.34 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 202 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  43.59 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  43.59 
 
 		 229 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  43.59 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  43.59 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  43.59 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.08 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  46.5 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.31 
 
 		 229 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45.96 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 213 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  42.14 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  42.14 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  42.14 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  45.51 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  45.51 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 222 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 222 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  42.04 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>