More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1647 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  61.86 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  64.41 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  57.63 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  61.74 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  62.07 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  60.68 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  57.63 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  62.61 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  59.83 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  58.47 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  58.12 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  58.12 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  53.33 
 
 		 120 aa  150  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  55.56 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  57.39 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  57.52 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  55.93 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  55.08 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  52.89 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  52.89 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  53.45 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  54.7 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  50.41 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  55.65 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  55.65 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  54.24 
 
 		 123 aa  141  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  52.07 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  56.88 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  51.69 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  57.63 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  51.79 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  53.66 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  53.85 
 
 		 123 aa  136  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  50.86 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  51.69 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  47.46 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  52.17 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  55.65 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  51.33 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  50.85 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  49.15 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  47.46 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  54.87 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  49.14 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  47.79 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  43.9 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  43.9 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  47.79 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  47.32 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  46.61 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  48.28 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  53.21 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  52.29 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  51.75 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  52.29 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  53.21 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  50.46 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  47.27 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  44.76 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  44.76 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  43.22 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.12 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  49.02 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  49.02 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  43.56 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  47.06 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  46.67 
 
 		 178 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  47.06 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  47.06 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  47.06 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  44.55 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  45.71 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  48.04 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  42.72 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  43.69 
 
 		 287 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  47 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  35.64 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  44.66 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  43.69 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  39.47 
 
 		 289 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  42.57 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  39.47 
 
 		 289 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  42.57 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  41.51 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  40 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  42.16 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  42.16 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  50 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  42.16 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  42.16 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  42.16 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  40.57 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  40.57 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  50.54 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>