More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1636 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
661 aa  1292  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  100 
 
 
661 aa  1292  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  52.42 
 
 
667 aa  607  1e-172  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  52.31 
 
 
666 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  51.55 
 
 
668 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  50.92 
 
 
659 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  51.36 
 
 
667 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  52.37 
 
 
678 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  51.55 
 
 
668 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  50.77 
 
 
674 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  52.22 
 
 
668 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  52.22 
 
 
668 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  52.06 
 
 
670 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  51.99 
 
 
663 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  52.22 
 
 
670 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  52.2 
 
 
669 aa  576  1e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  52.15 
 
 
663 aa  577  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  52.2 
 
 
669 aa  572  1e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  52.2 
 
 
669 aa  572  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  52.2 
 
 
669 aa  572  1e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  52.2 
 
 
669 aa  572  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  52.2 
 
 
669 aa  572  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  49.92 
 
 
661 aa  562  1e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  48.59 
 
 
652 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  52.94 
 
 
658 aa  555  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  49.54 
 
 
659 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  50.08 
 
 
659 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  47.79 
 
 
656 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  47.26 
 
 
660 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  50.08 
 
 
680 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  49 
 
 
659 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  47.39 
 
 
660 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  50.16 
 
 
655 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  49.38 
 
 
664 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  49.62 
 
 
661 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  41.45 
 
 
662 aa  515  1e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  48.96 
 
 
661 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  49.14 
 
 
665 aa  508  1e-142  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  48.99 
 
 
661 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  47.75 
 
 
661 aa  494  1e-138  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 
666 aa  480  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  49.14 
 
 
661 aa  470  1e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 
657 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  40.43 
 
 
650 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.74 
 
 
654 aa  462  1e-128  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  39.76 
 
 
720 aa  454  1e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  40.64 
 
 
649 aa  453  1e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.92 
 
 
655 aa  446  1e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  40.73 
 
 
648 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  40.88 
 
 
648 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  40.88 
 
 
648 aa  448  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  40.7 
 
 
649 aa  445  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  41.19 
 
 
648 aa  440  1e-122  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  38.41 
 
 
654 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.33 
 
 
649 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  40.33 
 
 
649 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  39.79 
 
 
648 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  40.71 
 
 
653 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.06 
 
 
648 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  39.67 
 
 
648 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  39.67 
 
 
648 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  41.01 
 
 
648 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  41.18 
 
 
574 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  42.63 
 
 
570 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.13 
 
 
572 aa  352  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 
666 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.1 
 
 
579 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 
674 aa  340  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.94 
 
 
697 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.82 
 
 
533 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.99 
 
 
578 aa  330  6e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  39.18 
 
 
590 aa  329  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 
665 aa  328  2e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
636 aa  328  2e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
672 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 
666 aa  321  2e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.8 
 
 
658 aa  320  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.88 
 
 
666 aa  319  8e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 
591 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  35.42 
 
 
583 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 
664 aa  318  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 
775 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.22 
 
 
568 aa  315  1e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  33.81 
 
 
569 aa  315  2e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.22 
 
 
671 aa  314  3e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  36.96 
 
 
568 aa  313  5e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  37.24 
 
 
593 aa  313  7e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.45 
 
 
604 aa  308  1e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  37.24 
 
 
629 aa  308  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 
668 aa  307  4e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.99 
 
 
682 aa  306  9e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  38.43 
 
 
594 aa  304  4e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 
583 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.61 
 
 
602 aa  303  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  36.48 
 
 
630 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.91 
 
 
601 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.91 
 
 
601 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.45 
 
 
602 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.91 
 
 
601 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.72 
 
 
670 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>