86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1632 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  100 
 
 
374 aa  773  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  4.12854e-05  decreased coverage  1.82174e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  100 
 
 
374 aa  773  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  34.25 
 
 
344 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  2.48871e-05 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  33.64 
 
 
346 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  32.7 
 
 
380 aa  184  2e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  31.74 
 
 
393 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  31.44 
 
 
364 aa  166  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  30.2 
 
 
349 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  32.6 
 
 
424 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  32.6 
 
 
424 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  32.6 
 
 
424 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  32.6 
 
 
410 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  32.6 
 
 
424 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  32.6 
 
 
426 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  32.59 
 
 
313 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  32.61 
 
 
454 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  27.25 
 
 
352 aa  132  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  26.33 
 
 
349 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  28.52 
 
 
351 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  26.81 
 
 
352 aa  129  7e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  27.51 
 
 
352 aa  114  4e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  29.11 
 
 
350 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  26.27 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  25.15 
 
 
376 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.4 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.48 
 
 
357 aa  84.7  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.69 
 
 
359 aa  82.8  9e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  27.05 
 
 
376 aa  78.2  2e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.41 
 
 
349 aa  77.4  4e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
354 aa  75.5  2e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  23.9 
 
 
343 aa  74.3  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  4.71341e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  27.42 
 
 
351 aa  74.3  3e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  22.6 
 
 
343 aa  73.9  4e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  23.51 
 
 
343 aa  73.9  4e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  23.42 
 
 
362 aa  72.4  1e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  21.77 
 
 
343 aa  70.5  5e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79604e-13 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  21.77 
 
 
343 aa  69.7  8e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  22.71 
 
 
319 aa  68.9  1e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  22.54 
 
 
343 aa  68.9  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.2569e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  22.71 
 
 
319 aa  68.9  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  22.71 
 
 
319 aa  68.9  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
376 aa  68.6  2e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
335 aa  68.6  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  21.52 
 
 
356 aa  68.6  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  24.28 
 
 
357 aa  67.8  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  23.68 
 
 
435 aa  67.4  4e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  2.71264e-06 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  23.65 
 
 
448 aa  66.6  6e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
348 aa  65.1  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.09 
 
 
374 aa  65.1  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  22.18 
 
 
343 aa  65.5  2e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  23.96 
 
 
471 aa  65.1  2e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  23.13 
 
 
349 aa  62.8  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.16 
 
 
391 aa  61.2  3e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  22.82 
 
 
349 aa  60.8  3e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  24.78 
 
 
388 aa  59.3  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  22.8 
 
 
405 aa  58.2  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  24.11 
 
 
348 aa  58.5  2e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.49 
 
 
405 aa  58.5  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  22.68 
 
 
358 aa  58.5  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  25.19 
 
 
328 aa  58.2  3e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  23.08 
 
 
418 aa  57.8  3e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  23.75 
 
 
352 aa  58.2  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  26.48 
 
 
344 aa  57  6e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  20.63 
 
 
394 aa  55.5  1e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  23.49 
 
 
362 aa  56.2  1e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  23.99 
 
 
358 aa  55.8  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  22.19 
 
 
495 aa  54.3  3e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
353 aa  53.9  4e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  22.84 
 
 
387 aa  53.5  7e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  22.55 
 
 
353 aa  53.1  7e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  27.78 
 
 
375 aa  53.1  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  20.25 
 
 
317 aa  51.2  3e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  22.26 
 
 
435 aa  50.8  4e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
286 aa  50.1  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  32.69 
 
 
365 aa  49.7  8e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  24.27 
 
 
362 aa  49.7  9e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  3.83129e-06  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  21.43 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  37.5 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  20.44 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.91 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.80374e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  24 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.56 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  32.29 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  21.1 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  21.96 
 
 
366 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>