More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1602 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 362 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 363 aa  736    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  54.18 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  54.47 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0900  hypothetical protein  60.12 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  54.57 
 
 		 376 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  53.93 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  56.47 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  54.18 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  55.26 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  53.67 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  52.48 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  53.28 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  53.6 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  51.83 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  53.56 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  52.11 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  53.28 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  53.56 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  54.18 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  53.28 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  53.28 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  53.28 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  52.45 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  52.32 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  53.89 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  53.28 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  51.83 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  54.34 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  52.99 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  54.12 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  51.12 
 
 		 401 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  53.94 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  50.72 
 
 		 370 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.86 
 
 		 373 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  51.81 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 		 373 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49 
 
 		 373 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49 
 
 		 373 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49 
 
 		 373 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  50 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  52.02 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  50 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  50.27 
 
 		 402 aa  359  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.71 
 
 		 373 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  52.49 
 
 		 428 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1716  radical SAM protein  49.16 
 
 		 401 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.6 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1780  hypothetical protein  49.16 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  50.54 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  52.77 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0663  radical SAM enzyme, Cfr family  51.84 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0103846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  50.54 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  51.43 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  51.75 
 
 		 430 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  50.27 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  51.66 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.13 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  50 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  50 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  51.49 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  48.55 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  48.55 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  48.55 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  51.66 
 
 		 399 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  48.55 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  47.88 
 
 		 379 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  49.46 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  47.44 
 
 		 382 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  48.84 
 
 		 381 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  47.44 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  46.61 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  49 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  51.38 
 
 		 398 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  49.59 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.99 
 
 		 392 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  51.43 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  50.86 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  50.86 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  48.41 
 
 		 384 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.41 
 
 		 384 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.41 
 
 		 384 aa  346  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  48.55 
 
 		 378 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  50 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>