More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1594 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  100 
 
 		 405 aa  793    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 405 aa  793    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  66.67 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  67.95 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  67.69 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  66.67 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  65.23 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  68.53 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  67.77 
 
 		 402 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  66.15 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  65.23 
 
 		 400 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  65.56 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  64.29 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  64.32 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  66.33 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  66.07 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  65.74 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  66.33 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  65.82 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  63.85 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  66.07 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  65.31 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  65.56 
 
 		 400 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  67.77 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  65.31 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  64.72 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  64.72 
 
 		 400 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  67.77 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  67.52 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  65.64 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  67.35 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  62.59 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  65.48 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  64.27 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  67.52 
 
 		 460 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  67.26 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  62.95 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  64.52 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  63.85 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  61.62 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  67.01 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  62.47 
 
 		 400 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  58.71 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  60.25 
 
 		 404 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  59.8 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  60.05 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  60.31 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  59.8 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  59.29 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  59.03 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  38.19 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.75 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  39.25 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  38 
 
 		 411 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  38.22 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  39 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  37 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  37.72 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  37.72 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  38.5 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  39 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  38.13 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  35.87 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  35.73 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  36.47 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  35.52 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  36.19 
 
 		 445 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  36.52 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.38 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  37.2 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  37.2 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.25 
 
 		 515 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.25 
 
 		 515 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.25 
 
 		 483 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  36.06 
 
 		 471 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  35.65 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  35.95 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  35.68 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  34.64 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  38.24 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  35.41 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.99 
 
 		 497 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  35.68 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  35.97 
 
 		 525 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  36.49 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  36.27 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.33 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  35.38 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  34.05 
 
 		 445 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  33.89 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  34.31 
 
 		 1209 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.26 
 
 		 1016 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  35.71 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  34.29 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  36.19 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  35.11 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  34.94 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  34.37 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  34.63 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  33.73 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>