109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1547 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  42 
 
 
302 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  43.81 
 
 
302 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  33.98 
 
 
274 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  33.5 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.12 
 
 
252 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  34.63 
 
 
280 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  34.68 
 
 
272 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.14 
 
 
252 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.77 
 
 
276 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.22 
 
 
286 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.63 
 
 
252 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.79 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.58 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.95 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.79 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.35 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  28.68 
 
 
372 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  44.62 
 
 
203 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  44.62 
 
 
203 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.98 
 
 
257 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.6 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.77 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.75 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  27.75 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.75 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.75 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.75 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.75 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  39.47 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.75 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.7 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  39.44 
 
 
225 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.41 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.3 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.44 
 
 
178 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.69 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  41.82 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.49 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.77 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.77 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.49 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  39.23 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  39.23 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  32.72 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  36.79 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  29.17 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  36.43 
 
 
201 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  26.92 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  28.38 
 
 
533 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  27.85 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2292  hypothetical protein  34.55 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  29.05 
 
 
530 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4190  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0081  hypothetical protein  23.49 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0094  hypothetical protein  23.49 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.892093  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.21 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.21 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.21 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  32.31 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  23.53 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  26.09 
 
 
245 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.54 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.02 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  26.77 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  26.7 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  29.63 
 
 
122 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  23.4 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  27.78 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.49 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  25.12 
 
 
245 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.65 
 
 
254 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.46 
 
 
246 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  28.67 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.64 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.16 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  24.16 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.12 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.56 
 
 
210 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.66 
 
 
238 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  29.07 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.12 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.48 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.15 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  28.79 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.07 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  25.53 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  23.38 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  27.78 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>