More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1504 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  56.03 
 
 		 365 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  56.03 
 
 		 365 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45.7 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 353 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  47.15 
 
 		 369 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  47.97 
 
 		 363 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 363 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 354 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 363 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 404 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 404 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 407 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  47.15 
 
 		 364 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 407 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 382 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 407 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 407 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  38.29 
 
 		 407 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  45.97 
 
 		 407 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 418 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  46.22 
 
 		 404 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 248 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  44.93 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  45.3 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  37.57 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  45 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  33.69 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  42.42 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  48.62 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  42.5 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.41 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  45.53 
 
 		 170 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.7 
 
 		 333 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  40.94 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  41.09 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 265 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  43.59 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  42.74 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  44.95 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0829  NLP/P60 protein  40 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.846153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.74 
 
 		 234 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 234 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 234 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  46.03 
 
 		 225 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.74 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.74 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  36.71 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  37.5 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  48.67 
 
 		 532 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  41.88 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  40.17 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 298 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  29.86 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  40.88 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 536 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 256 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.22 
 
 		 391 aa  99.4  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 454 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  34.73 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 208 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 275 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 532 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  34.48 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  47.41 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 208 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 476 aa  97.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 232 aa  97.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>