142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1479 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1802  aldolase  100 
 
 
306 aa  634    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  100 
 
 
306 aa  634    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  57.24 
 
 
297 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  58.5 
 
 
307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  56.46 
 
 
307 aa  349  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  56.04 
 
 
300 aa  348  5e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  53.85 
 
 
308 aa  346  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  56.44 
 
 
302 aa  345  4e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  54.49 
 
 
307 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  52.36 
 
 
308 aa  342  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  55.67 
 
 
304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  51.69 
 
 
308 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  50.34 
 
 
304 aa  331  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  51.69 
 
 
308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  51.29 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  51.47 
 
 
313 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  49.51 
 
 
312 aa  293  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  48.32 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.77 
 
 
266 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  32.84 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  34.94 
 
 
280 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  32.25 
 
 
300 aa  105  9e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  31 
 
 
299 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 
260 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
264 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  30.32 
 
 
304 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  30.77 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  30.51 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  31.65 
 
 
309 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  30.26 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  31.29 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  31.29 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  30.94 
 
 
307 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  29.54 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  30.89 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0612637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  30.49 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  26.1 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  30.08 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  27.15 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  29.5 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  28.96 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  26.35 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  29.63 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  33.97 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  25.74 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  31.15 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.15 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  28.51 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  30.69 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  25.25 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  32.08 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  26.73 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  28.04 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  30.77 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  24.09 
 
 
356 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  24.32 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  24.07 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  25.09 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  28.64 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  31.01 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  33.94 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  23.86 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  29.8 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  25.26 
 
 
349 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  34.34 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  31.93 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  23.91 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  31.33 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.61 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  29.8 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  29.01 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  29.94 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  32.03 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  25.16 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  28.4 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  28.24 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  27.85 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  31.41 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  28.99 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  29.34 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  29.34 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
265 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  30.38 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  28.4 
 
 
260 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  28.4 
 
 
260 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  28.4 
 
 
260 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>